Wróć do informacji o e-podręczniku Wydrukuj Pobierz materiał do PDF Pobierz materiał do EPUB Pobierz materiał do MOBI Zaloguj się, aby dodać do ulubionych Zaloguj się, aby skopiować i edytować materiał Zaloguj się, aby udostępnić materiał Zaloguj się, aby dodać całą stronę do teczki
bg‑pink

Organizmy zmodyfikowane genetycznie

RekonHkkmwESm
Modyfikacje genetyczne budzące najwięcej kontrowersji polegają na wprowadzaniu do organizmu danego gatunku genów pochodzących od innych gatunków. Nadają one modyfikowanemu organizmowi pożądaną cechę, niewystępującą u niego naturalnie.
Źródło: Pixabay, domena publiczna.

Biotechnologia jest interdyscyplinarną dziedziną nauki wykorzystującą metody inżynierii genetycznej w celu uzyskania genetycznie zmodyfikowanych organizmówGMOgenetycznie zmodyfikowanych organizmów (ang. genetically modified organism GMO). Metody te polegają na rekombinacji DNA z użyciem nośników, tzw. wektorów (m.in. wirusowych, plazmidowych), na włączaniu materiału genetycznego przygotowanego poza organizmem (np. poprzez zastosowanie mikroiniekcjimikroiniekcjamikroiniekcji) lub na łączeniu materiału genetycznego dwóch komórek pochodzących od różnych gatunków, który może być przekazywany komórkom potomnym.

W procesie nazywanym ekspresją genów zawarta w nich informacja genetyczna zostaje odczytana i przepisana na białka lub RNA. Metody inżynierii genetycznej prowadzą do zmiany ekspresji genów na dwa sposoby. Po pierwsze, wprowadzenie dodatkowej kopii genu (występującego u danego gatunku) powoduje zwielokrotnienie pożądanej cechy, po drugie, wprowadzenie genu innego gatunku pozwala uzyskać nowe cechy, niewystępujące naturalnie u danych organizmów (w ten sposób powstają organizmy transgeniczneorganizmy transgeniczneorganizmy transgeniczne).

Genetycznie zmodyfikowane organizmy wykorzystywane są m.in. w badaniach biologicznych oraz medycynie molekularnej. Ich zastosowanie jest szczególnie ważne w badaniach nad nowotworami, chorobami dziedzicznymi oraz zakaźnymi.

bg‑azure

Metody modyfikowania genetycznego organizmów

Wśród metod umożliwiających wprowadzenie obcego DNA do genomu gospodarza wyróżnia się metodę wektorową oraz metody bezwektorowe.

Metoda wektorowa

Metoda wektorowa, skutecznie wykorzystywana w modyfikacji materiału genetycznego ryżu i zbóż, opiera się na wykorzystaniu naturalnej zdolności organizmu lub wirusa do przenoszenia materiału genetycznego.

Wirus lub plazmid bakterii pozbawia się infekcyjności i stosuje jako nośnik obcego DNA. Przykładem mikroorganizmu, który znalazł zastosowanie w biotechnologii, może być bakteria Agrobacterium tumefaciens, naturalnie żyjąca w glebie. Infekuje ona uszkodzone rośliny, a jej plazmid ma zdolność łączenia się z DNA gospodarza. 

Metody bezwektorowe

To metody, które nie wykorzystują żadnego „nośnika”, aby wprowadzić obce DNA do genomu.

Biolistyka polega na wstrzeliwaniu do wnętrza komórek zawierających DNA mikropocisków (wolframowych lub wykonanych ze złota).

Inna metoda bezwektorowa to wykorzystanie glikolu polietylowego (PEG) lub energii elektrycznej (elektroporacja) w celu rozluźnienia struktury błon komórkowych, co umożliwia penetrację komórki i włączenie obcego DNA. Zarówno metoda PEG, jak i elektroporacja wykorzystywane są do transformacji komórek zwierzęcych. Utrudnieniem w ich zastosowaniu w komórkach roślinnych jest obecność ściany komórkowej – po jej usunięciu metoda PEG i elektroporacja są możliwe do wykorzystania.

Aby zrozumieć poruszane w tym materiale zagadnienia, przypomnij sobie:

e‑materiał pt. Cele i metody transformacji genetycznej roślin i zwierzątDyK8caViCele i metody transformacji genetycznej roślin i zwierząt.

bg‑azure

Metoda knock‑out

Metoda knock‑outknock‑outknock‑out polega na usunięciu określonej sekwencji z chromosomalnego DNA, czego konsekwencją jest brak syntezy kodowanego przez ten gen białka. W wyniku usunięcia tej sekwencji w komórkach embrionalnych uzyskuje się organizm pozbawiony cechy kodowanej przez ten gen.

R1XtZd0aAsl8g1
Schemat przedstawia kolejne stadia powstawania transgenicznych myszy. To etapy tworzenia myszy knock-out z wykorzystaniem pierwotnych komórek zarodkowych. Poprzez proces celowania genów w komórkach ES, potencjalnie każda pożądana manipulacja genetyczna może być wprowadzona do linii zarodkowej myszy. Specyficzne sekwencje genów mogą być usuwane konstytutywnie lub warunkowo. To knock-out. Wektor docelowy jest transfekowany do komórek ES i rekombinowane klony są badane pod kątem pożądanego zdarzenia rekombinacji homologicznej. Komórki są następnie wstrzykiwane do zarodków przedimplantacyjnych, a powstałe w ten sposób myszy chimeryczne są wykorzystywane do hodowli genetycznie zmodyfikowanej linii myszy zarodkowych. Izoluje się i przechowuje niezależne klony komórek rekombinowanych. Przygotowywane jest DNA i dostarczane na płytkach dołkowych do badań przesiewowych. W następnej kolejności przypuszczalnie pozytywne klony są odmrażane. Zachodzi ekspansja i przesiew potwierdzający. Dochodzi do analizy kariotypu docelowych klonów. Później dochodzi do wstrzyknięcia blastocysty klonów komórek ES. Komórki ES są wstrzykiwane do zarodka przedimplantacyjnego. Generowane i przetrzymywane są mysie chimery przez okres do trzech tygodni. Rekomendowane są możliwie najlepsze strategie hodowlane kolejnych linii zarodkowych myszy. W ten sposób można wygenerować humanizowane modele mysie. Mysz to mały gryzoń. Na skutek rekombinacji genetycznych można uzyskać pożądany kolor czy rozmiar zwierzęcia. Proces polega na usunięciu określonej sekwencji z chromosomalnego DNA, czego konsekwencją jest brak syntezy kodowanego przez ten gen białka. W wyniku usunięcia tej sekwencji w komórkach embrionalnych uzyskuje się organizm pozbawiony cechy kodowanej przez ten gen. Komórki DNA są wstrzykiwane do embrionalnych komórek DNA przy pomocy elektroporacji. W wybranych komórkach w warunkach in vitro zachodzi rekombinacja homologiczna, na przykład delekcja danego genu. Dochodzi do wprowadzenia komórek macierzystych do blastocysty. Następuje transfer blastocysty do macicy matki zastępczej. Powstają chimery, których organizm składa się zarówno z komórek zmodyfikowanych, jak i niezmodyfikowanych genetycznie. Dochodzi do krzyżowania organizmu chimerycznego z niezmodyfikowaną genetycznie homozygotą. W pierwszym pokoleniu otrzymuje się homozygoty nie posiadające zmodyfikowanego genu. Na schemacie to myszy białe. Oraz heterozygoty, które posiadają chromosom ze zmodyfikowanym fragmentem DNA w każdej komórce ciała. To myszy czarne. Po skrzyżowaniu dwóch heterozygot część osobników potomnych będzie homozygotami z całkowicie wyłączonym genem na obu chromosomach homologicznych, a część będzie posiadała niezamieniony gen na jednym lub obu chromosomach homologicznych.
Etapy tworzenia myszy knock‑out z wykorzystaniem pierwotnych komórek zarodkowych (ang. embryo stem cells - ESCs).
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o. o., licencja: CC BY-SA 3.0.

Za pomocą elektroporacjielektroporacjaelektroporacji przygotowany fragment DNA zostaje wprowadzony do modyfikowanych komórek macierzystychmacierzyste komórkikomórek macierzystych (punkt 2. na schemacie), w których następuje wyłączenie genu – knock‑out (punkt 3. na schemacie). Zmodyfikowane komórki, w których badany gen został wyłączony, są namnażane, a następnie wprowadzane do blastocysty (punkt 4.). Blastocysta wprowadzana jest do macicy matki zastępczej (punkt 5.). Połączenie komórek zmodyfikowanych genetycznie z komórkami zarodka skutkuje powstaniem chimerychimerachimery (punkt 6.). Taki organizm składa się zarówno z komórek zmodyfikowanych, jak i niezmodyfikowanych genetycznie.

W kolejnym pokoleniu, w przypadku gdy to komórki ze zmienionym (wyłączonym)  genem dają początek komórkom rozrodczym, potomstwo powstałe z połączenia tych komórek jest heterozygotyczne (punkt 8. na schemacie). Krzyżując ze sobą dwa osobniki heterozygotyczne można otrzymać potomstwo homozygotyczne z całkowicie wyłączonym gen na obu chromosomach homologicznych (punkt 9.), czyli tzw. zwierzęta knock‑out.

Metoda knock‑out wykorzystywana jest głównie do poznawania funkcji genów poprzez analizę skutków ich wyłączenia. Zwierzęta knock‑out (np. myszy) są przydatne m.in. w badaniach z zakresu genetyki rozwoju oraz jako zwierzęce modele chorób genetycznych u człowieka.

bg‑cyan

Wykorzystanie organizmów genetycznie zmodyfikowanych

Istotą badań podstawowych jest wzbogacanie wiedzy z danej dziedziny lub dyscypliny oraz formułowanie ogólnych praw nauki. Dla takich celów prowadzi się prace eksperymentalne lub teoretyczne bazujące na dotychczasowych uogólnieniach. Na ich podstawie konstruowany jest problem badawczy, który następnie podlega wyjaśnieniom teoretycznym. Rozważania prowadzą do nowych hipotez, weryfikowanych w sposób empiryczny (doświadczalny). Uzyskane wyniki umożliwiają tworzenie nowych teorii i tym samym poszerzenie bazy wiedzy stanowiącej podstawę do formułowania kolejnych problemów badawczych. W wyniku badań podstawowych uzyskuje się odpowiedzi na pytania: „Co? Jak? Dlaczego?” oraz „Jakie procesy/zależności występują pomiędzy zjawiskami?”.  Wykorzystanie zdobytej podczas badań podstawowych wiedzy nie jest nastawione na bezpośrednie zastosowanie komercyjne.

Organizmy modyfikowane genetycznie wykorzystywane do badań podstawowych to: muszki owocowe, szczury, króliki, kury i – najczęściej – myszy. Zwierzęta te mają najwięcej wspólnych cech (genetycznych, anatomicznych i fizjologicznych) z człowiekiem. Dlatego możliwe jest poznanie mechanizmów molekularnych zachodzących w zdrowym organizmie, podczas chorób oraz w okresie rozwoju różnych układów, np. nerwowego, a następnie wykorzystanie tej wiedzy w odniesieniu do człowieka.

Transgeniczne muszki owocowe, w których komórkach dany gen został wyciszony, wykorzystywane są do badań funkcjonalnych – np. do badań neurobiologicznych nad chorobą Parkinsona i chorobą Alzheimera. Podobnie zmodyfikowane genetycznie rośliny są modelem umożliwiającym badania nad funkcją genów.

R1COoqqrRW7Yw
Do genomu myszy wprowadzono gen kodujący białko, które w świetle UV daje barwę zieloną. Myszy transgeniczne w świetle ultrafioletowym mają zieloną barwę oczu.
Źródło: Ingrid Moen, Charlotte Jevne, Jian Wang, Karl-Henning Kalland, Martha Chekenya, Lars A. Akslen, Linda Sleire, Per Ø. Enger, Rolf K. Reed, Anne M. Øyan, Linda E.B. Stuhr, licencja: CC BY 2.0.

Zwierzęta transgeniczne (myszy, króliki, szczury), u których usunięto poszczególne geny, są modelem chorób kardiologicznych, neurologicznych, pulmonologicznych, hematologicznych, onkologicznych oraz embriologicznych, polegających na upośledzeniu rozwoju narządów i układów. Zwierzęta te wykorzystywane są również w badaniach immunologicznych związanych z chorobami autoagresywnymi, niedoborami odpornościowymi oraz alergiami.

bg‑gray2
Ważne!

Badania prowadzone na genetycznie zmodyfikowanych organizmach dotyczące różnych jednostek chorobowych wymagają ostrożności. Wprowadzony zmieniony gen powodujący chorobę może wywoływać jedynie część objawów i nie dawać pełnego obrazu klinicznego. Otrzymane wyniki wymagają potwierdzenia w badaniach in vivoin vivoin vivoin vitroin vitroin vitro.

Przykład stanowią myszy będące modelem chorób onkologicznych i myszy modelowe chorób immunologicznych.

Myszy Li‑Fraumeni jako model chorób onkologicznych

Myszy Li‑Fraumeni są modelem rzadkiego zespołu dziedziczonego autosomalnie dominująco, spowodowanego mutacją w genie TP53. Jest on antyonkogenem określanym jako supresor (czynnik hamujący) nowotworów. Mutacja tego genu powoduje wzrost ryzyka zachorowania na różne typy nowotworów (np. mózgu, piersi, skóry, mięsaki) w młodym wieku i prowadzi do powstawania guzów złośliwych. Myszy Li‑Fraumeni otrzymuje się poprzez zastosowanie techniki knock‑out ukierunkowanej na zmiany w genie TP53 (wyciszenie genu).

Myszy modelowe chorób immunologicznych

Unieczynnienie genów interleukin u myszy – interleukiny 10 (IL‑10) i interleukiny 2 (IL‑2) – powoduje wrzodziejące zapalenie jelit. Z kolei usunięcie transformującego czynnika wzrostu beta 1 (TGFbeta1) jest przyczyną wielonarządowych zmian zapalnych.

bg‑gray2
Ważne!

Poznanie genu kodującego białko odpowiedzialne za powstawanie stanu patologicznego jest istotne dla stworzenia genetycznie zmodyfikowanego organizmu stanowiącego model choroby. Jednak w niektórych sytuacjach usunięcie sekwencji związanej z chorobą jest dla gatunku typowanego jako model choroby letalne (śmiertelne). Dlatego do tej pory nie udało się stworzyć np. modelu pląsawicy Huntingtona.

Już wiesz

Białko zielonej fluorescencji (ang. green fluorescent protein – GFP) naturalnie występujące u meduzy Aequorea victoria jest użytecznym narzędziem w biologii doświadczalnej. Umożliwia obserwację przemieszczania się komórek i białek w organizmie. Transfekcja genu GFP do zarodka np. myszy pozwala na obserwację rozwoju zarodka aż do przekształcenia się go w wielokomórkowy płód.

Słownik

chimera
chimera

organizm zbudowany z komórek różniących się genetycznie

dziedziczenie autosomalne dominujące
dziedziczenie autosomalne dominujące

cecha dziedziczona jest w sprzężeniu z chromosomami innymi niż płci, ujawnia się u heterozygot i homozygot dominujących

dziedziczenie autosomalne recesywne
dziedziczenie autosomalne recesywne

cecha dziedziczona jest w sprzężeniu z chromosomami innymi niż płci oraz ujawnia się tylko u homozygot recesywnych

elektroporacja
elektroporacja

bezwektorowa metoda modyfikacji genetycznych; wskutek oddziaływania impulsów elektrycznych na błonę komórkową dochodzi w niej do powstania trwałych hydrofilowych porów, tzw. elektroforów; obecność dodatkowych kanałów ułatwia przenikanie fragmentów DNA ze środowiska zewnętrznego do wnętrza komórek

GMO
GMO

organizmy modyfikowane genetycznie, których genom został zmieniony za pomocą metod inżynierii genetycznej

heterozygota
heterozygota

organizm posiadający zróżnicowane allele danego genu

homozygota
homozygota

organizm posiadający identyczne allele danego genu

in vivo
in vivo

określenie procesu zachodzącego wewnątrz organizmu

in vitro
in vitro

określenie procesu przeprowadzanego w warunkach laboratoryjnych

inaktywacja
inaktywacja

zanik, zahamowanie lub utrata właściwości

knock‑out
knock‑out

metoda biologii molekularnej polegająca na usunięciu genu

macierzyste komórki
macierzyste komórki

niezróżnicowane komórki występujące naturalnie w organizmie u zwierząt i człowieka, a także wyhodowane in vitro (pierwotne komórki zarodkowe), zdolne do nieograniczonych podziałów (proliferacji) przez całe życie organizmu

mikroiniekcja
mikroiniekcja

metoda umożliwiająca wprowadzenie dowolnej substancji, np. obcego DNA, do komórki obserwowanej pod mikroskopem

organizmy transgeniczne
organizmy transgeniczne

organizmy, których genom został zmieniony, a wprowadzony gen pochodzi od organizmu innego gatunku

transformacja
transformacja

proces aktywnego pobierania DNA z otoczenia