bg‑azure

Istota i lokalizacja fosforylacji oksydacyjnej

Ilość energii potrzebna mężczyźnie ważącemu 70 kg i prowadzącemu tryb życia o umiarkowanej intensywności to aż 8400 kJ (2000 kcal) dziennie. Dostarczenie tak dużej porcji energii wymaga 83 kg ATP. Jednakże w organizmie człowieka w danym momencie ilość ATP wynosi zaledwie 250 g. Na szczęście różnica między ogólnie wymaganą ilością ATP a tą, którą dysponujemy w danym momencie, nie jest problemem, ponieważ ADP jest ponownie wykorzystywany do syntezy ATP. Każda cząsteczka ATP jest odzyskiwana około 300 razy dziennie, dzięki procesowi fosforylacji oksydacyjnejfosforylacja oksydacyjnafosforylacji oksydacyjnej.

Fosforylacja oksydacyjna u organizmów eukariotycznych zachodzi w wewnętrznej błonie mitochondrialnej, natomiast u prokariontów – w ich błonie komórkowej.

Wytworzenie ATP na drodze fosforylacji oksydacyjnej jest reakcją egzoenergetyczną, którą można zapisać w postaci następującego równania:

A D P + P i + N A D H + H + + F A D H 2 + O 2     A T P + N A D + + F A D + 2 H 2 O

W błonie wewnętrznej mitochondriów znajdują się zespoły (kompleksy) związków chemicznych uszeregowanych zgodnie ze wzrastającym potencjałem oksydoredukcyjnym i coraz większą elektroujemnością. Związki te tworzą łańcuch oddechowyłańcuch oddechowyłańcuch oddechowy. Potencjał oksydoredukcyjny, nazywany też potencjałem redoks, to zdolność danego związku chemicznego do przyjmowania i oddawania elektronów.  W łańcuchu oddechowym elektrony są transportowane od związków bardziej zredukowanych do tych o większym stopniu utlenienia, by ostatecznie dotrzeć do cząsteczki tlenu o największej elektroujemności.

NADH i FADH2, czyli zredukowane formy uniwersalnych przenośników protonów i elektronówuniwersalne przenośniki protonów i elektronówuniwersalnych przenośników protonów i elektronów, otrzymywane podczas glikolizyglikolizaglikolizy, reakcji pomostowejreakcja pomostowareakcji pomostowej oraz cyklu Krebsacykl Krebsacyklu Krebsa, są utleniane przez składniki łańcucha oddechowego. Elektrony pochodzące z NADH i FADH2 są przenoszone przez zakotwiczone w błonie wewnętrznej mitochondrium składniki łańcucha oddechowego, uszeregowane zgodnie ze wzrastającą elektroujemnością.

Transport elektronów w łańcuchu kończy się, gdy zostaną one przekazane na tlen – cząsteczkę o największej elektroujemności.

W wyniku takiego uporządkowanego przepływu elektronów wzdłuż błony wewnętrznej mitochondriów, uwolniona zostaje energia, która wykorzystana jest do przepompowania protonów (jonów HIndeks górny +) w poprzek tej błony – z matriks mitochondrium do przestrzeni międzybłonowej (perimitochondrialnej).

W wyniku tego procesu dochodzi do kumulacji jonów HIndeks górny + w przestrzeni międzybłonowej. Łańcuch oddechowy umożliwia więc wytworzenie gradientu stężeń protonów, których energia jest następnie wykorzystana do syntezy ATP.

bg‑azure

Składniki łańcucha oddechowego

Wewnętrzna błona mitochondrialna tworzy fałdy – grzebienie mitochondrialne. Znacznie zwiększają one powierzchnię, na której znajdują się składniki łańcucha oddechowego.

W skład łańcucha oddechowego wchodzą cztery kompleksy białkowe. Są to trzy pompy protonowe o nazwach: oksydoreduktaza NADH‑Q (kompleks I), nazywana dehydrogenazą NADH, oksydoreduktaza Q–cytochrom c (kompleks III) i oksydaza cytochromu c (oksydaza cytochromowa, kompleks IV), oraz wielki kompleks białkowy reduktaza bursztynian–Q (kompleks II), który jest bezpośrednio związany z cyklem Krebsa. Połączone kompleksy I, III i IV tworzą kompleks wielkocząsteczkowy (supramolekularny) – respirasom. Ułatwia on szybkie przenoszenie elektronów ze zredukowanych substratów, a także zapobiega uwalnianiu pośrednich form reakcji.

Elektrony są transportowane pomiędzy danymi kompleksami przez dwa specjalne nośniki elektronów: koenzym Q, nazywany również ubichinonemubichinon, koenzym Qubichinonem, oraz cytochrom c. W transporcie elektronów w łańcuchu oddechowym można wyróżnić cztery etapy.

R1VpCZy84HeFj1
Schemat przedstawia układ przenośników elektronów w łańcuchu transportu elektronów oraz spadek energii swobodnej podczas wędrówki elektronów w dół łańcucha. Po przyjęciu elektronów od mniej elektroujemnego składnika, położnego wyżej na rycinie, składnik łańcucha ulega redukcji. Następnie – oddając elektrony do kolejnego, bardziej elektroujemnego składnika – przechodzi w formę utlenioną.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
R19eeMFzWXbbe1
Łańcuch oddechowy składa się z czterech etapów. Pierwszy etap polega na tym, że dwa elektrony przenoszone są z NADH na grupę prostetyczną kompleksu pierwszego – mononukleotyd flawinowy (FMN), który przechodzi w formę zredukowaną FHNH indeks dolny 2. Następnie elektrony z FHNH indeks dolny 2 zostają przekazane na białko żelazowo siarkowe (Fe-S). W dalszej kolejności przekazywane są na koenzym Q (Q). Po przyjęciu dwóch elektronów przez Q powstaje jego zredukowana postać QH indeks dolny 2. W drugim etapie FADH indeks dolny 2 to enzym wchodzący w skład kompleksu drugiego, który zasila łańcuch transportu elektronów. Jego elektrony przenoszone są na centra białka żelazowo siarkowego a następnie na koenzym. Skutkuje to powstaniem QH indeks dolny 2, z którego elektrony przenoszone są na kolejny element łańcucha oddechowego, to znaczy kompleks trzeci. Kompleks trzeci katalizuje przeniesienie elektronów z QH indeks dolny 2 do cytochromu c (cyt c). Zawiera on dwa rodzaje cytochromów: b i c indeks dolny 1. Cytochromy mają jako grupę prostetyczną grupę hemową, czyli żelazoprotoporfirynę IX. Grupa ta zawiera jon żelaza, który podczas transportu elektronów zmienia stopień utlenienia od formy zredukowanej Fe indeks górny 2+ do formy utlenionej Fe indeks górny 3+. Oprócz cytochromów w kompleksie trzecim występuje białko żelazowo siarkowe z centrum typu 2Fe-2S (centrum Rieskiego). Kompleks czwarty katalizuje przeniesienie elektronów z cytochromu c na tlen cząsteczkowy, który jest końcowym akceptorem. Cząsteczce tlenu przekazywane są cztery elektrony, w wyniku czego zostaje ona zredukowana do dwóch cząsteczek wody.
bg‑azure

Synteza ATP

W 1961 r. brytyjski biochemik Peter Mitchell wysunął tzw. hipotezę chemiosmotyczną, mówiącą, że transport elektronów i synteza ATP są ze sobą sprzężone. Dzieje się tak dzięki utworzonemu w poprzek wewnętrznej błony mitochondrialnej gradientowi protonowemu. Przenoszenie elektronów wzdłuż łańcucha oddechowego prowadzi do pompowania protonów ze strony matriks na stronę cytoplazmatyczną wewnętrznej błony mitochondrialnej. Stężenie HIndeks górny + w matriks maleje, rośnie zaś w przestrzeni międzybłonowej, co prowadzi do powstania gradientu elektrochemicznego. Wówczas protony z powrotem przepływają do matriks, dzięki czemu ich stężenie w poprzek błony zostaje wyrównane. Taki przepływ protonów napędza syntezę ATP przez syntazę ATP (kompleks V). Efekt korzystnego energetycznie nierównomiernego rozłożenia protonów nazywa się siłą protonomotoryczną. Ma ona dwie składowe: gradient elektryczny i chemiczny. Hipoteza Mitchella została potwierdzona eksperymentalnie.

Ciekawostka

Początkowo hipoteza chemiosmotyczna Mitchella nie została przyjęta zbyt entuzjastycznie. Jeden z naukowców zajmujących się syntazą ATP, Efraim Racker, wspominał, że część badaczy uważała Mitchella za „nadwornego błazna”, którego praca nie ma żadnego znaczenia. Obecnie jednak odkrycie zjawiska napędzania reakcji syntazy ATP przez gradient protonowy uznaje się za jedno z dwóch (obok poznania struktury DNA) najważniejszych odkryć biologicznych XX w. W 1978 r. Peter Mitchell został uhonorowany Nagrodą Nobla w dziedzinie chemii.

Więcej o syntezie ATP dowiesz się z e‑materiału pt. Sposoby syntezy ATP w komórce.

R2lzyr9nG6Oo61
Na ilustracji interaktywnej przedstawiono proces syntezy ATP w wyniku fosforylacyji oksydacyjnej. Grafika podzielona jest na trzy obszary: przestrzeń perimitochondrialną, wewnętrzną błonę mitochondrialną o strukturze dwuwarstwy fosfolipidowej oraz macierz mitochondrialną. Na górze grafiki przedstawiono schematyczne mitochondrium oraz cytozol wokół niego. Jako pierwszy proces przedstawiono glikolizę zachodzącą w cytozolu, w efekcie której powstaje ATP oraz NADH biorące udział w kolejnych etapach. Od glikolizy biegnie strzałka do następnego etapu, zachodzącego już w mitochondrium, czyli do utleniania pirogronianu. Następnie strzałka biegnie do cyklu kwasu cytrynowego zachodzącego również w mitochondrium. W jego wyniku powstaje ATP, NADH oraz FADH2. NADH, FADH2 oraz NADH powstałe w wyniku glikolizy biorą udział w kolejnym etapie, czyli fosforylacji oksydacyjnej i łańcuchu oddechowym. Odbywają się one na wewnętrznej błonie mitochondrialnej. Na grafice ukazano powiększenie na wewnętrzną błonę mitochondrialną oraz struktury w niej występujące, czyli kompleks białkowy przenośników elektronów: kolejno przenośnik I, II, Q, III, Cyt C, IV, a na końcu syntaza ATP o cylindrycznym kształcie, częściowo zanurzona w błonie mitochondrialnej, skierowana do macierzy mitochondrialnej. Elektrony pochodzące z NADH oraz FADH2 wędrują kolejno przez wszystkie przenośniki elektronów. Transport elektronów wzdłuż łańcucha oddechowego umożliwia aktywne pompowanie protonów H + z macierzy mitochondrialnej do przestrzeni międzybłonowej. Powoduje to powstanie gradientu protonowego, a także prowadzi do redukcji tlenu cząsteczkowego do wody. Następnie zachodzi chemiosmoza, czyli synteza ATP z ADP i reszty fosforanowej, napędzana przez bierny (zgodny z gradientem stężeń) przepływ H + przez kanał syntazy ATP obecnej w błonie. Łańcuch transportu elektronów oraz chemiosmoza razem tworzą fosforylację oksydacyjną.
NADH i FADH2 przenoszą elektrony do łańcucha transportu elektronów zakotwiczonego w wewnętrznej błonie mitochondrium (zielone strzałki). Ostatecznie elektrony przekazywane są na akceptor – tlen, tworząc cząsteczkę wody, po jednoczesnym dołączeniu jonów wodorowych. Oprócz przyjmowania elektronów kompleksy I, III i IV pompują protony z macierzy mitochondrialnej do przestrzeni perimitochondrialnej. Energia chemiczna przekształcana zostaje w siłę protonomotoryczną, która wynika z gradientu błonowego H+.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
Ciekawostka

Znane wszystkim trucizny, takie jak cyjanekcyjankicyjanek czy tlenek węgla, działają szkodliwie na nasz organizm, hamując aktywność enzymu oksydazy cytochromu c. Prowadzi to do zatrzymania reakcji łańcucha oddechowego.

Słownik

cyjanki
cyjanki

sole kwasu cyjanowodorowego; ich niekorzystny wpływ na organizm wynika z wiązania się z atomami miedzi i żelaza, które wchodzą w skład enzymów łańcucha oddechowego

cykl Krebsa
cykl Krebsa

cykl kwasu cytrynowego, w którym substrat, jakim jest acetylokoenzym A, zostaje utleniony do COIndeks dolny 2 w wyniku wielu przemian biochemicznych

cytochromy
cytochromy

białka złożone, hemoproteiny, które dzięki odwracalnej zmianie stopnia utlenienia żelaza grupy hemowej (z FeIndeks górny 2+ na FeIndeks górny 3+) stanowią układ przenośników elektronów w łańcuchu oddechowym u roślin i zwierząt

dehydrogenazy
dehydrogenazy

grupa enzymów zdolna do odszczepienia atomów wodoru od związków organicznych

energia swobodna
energia swobodna

zdolność do wykonania pracy bez zmiany temperatury i ciśnienia układu

fosforylacja oksydacyjna
fosforylacja oksydacyjna

proces syntezy ATP w warunkach tlenowych z wykorzystaniem łańcucha oddechowego

glikoliza
glikoliza

(gr. glik – słodki; lysis – rozpuszczanie) szlak metaboliczny, w którym na skutek wielu reakcji biochemicznych z jednej cząsteczki glukozy powstają: dwie cząsteczki pirogronianu, dwie cząsteczki ATP, dwie cząsteczki NADH oraz cząsteczka wody

łańcuch oddechowy
łańcuch oddechowy

zespół enzymatycznych reakcji oksydacyjno‑redukcyjnych zachodzących w wewnętrznej błonie mitochondrium u organizmów eukariotycznych, natomiast u bakterii – w błonie plazmatycznej, katalizowany przez białkowe przenośniki elektronów zawierające: flawiny, centra żelazo‑siarkowe i hemy jako grupy prostetyczne

pompa protonowa
pompa protonowa

białko błonowe zdolne do transportowania protonów (HIndeks górny +) wbrew ich gradientowi stężeń

reakcja pomostowa
reakcja pomostowa

oksydacyjna dekarboksylacja pirogronianu – reakcja odłączania dwutlenku węgla od cząsteczki pirogronianu z jego jednoczesną dehydrogenacją i przyłączeniem powstałej reszty acetylowej do koenzymu A, w wyniku czego tworzy się acetylokoenzym A

syntaza ATP
syntaza ATP

enzym katalizujący reakcję wytwarzania ATP z ADP i fosforanu nieorganicznego

ubichinon, koenzym Q
ubichinon, koenzym Q

chinon będący specjalnym nośnikiem elektronów; przenosi elektrony między odpowiednimi kompleksami w łańcuchu oddechowym

uniwersalne przenośniki protonów i elektronów
uniwersalne przenośniki protonów i elektronów

NAD+, czyli forma utleniona  dinukleotydu nikotynoamidoadeninowego, oraz FAD, czyli  forma utleniona nukleotydu flawinoadeninowego – związki organiczne, które są akceptorami protonów i elektronów