Przeczytaj
Budowa RNA
RNA, czyli kwas rybonukleinowy, tak samo jak DNA, zbudowany jest z długich, nierozgałęzionych łańcuchów polinukleotydowych, złożonych z wielu nukleotydównukleotydów.
W skład nukleotydów tworzących RNA wchodzą następujące elementy:
NukleozydNukleozyd zbudowany z jednej z zasad azotowych (adeniny, cytozyny, guaniny lub uracylu) połączonej z pierwszym atomem węgla (1′) pięciowęglowego cukru rybozyrybozy wiązaniem N‑glikozydowym.
Grupa fosforanowa połączona z nukleozydem wiązaniem estrowym.
Jedną z różnic pomiędzy nukleotydami obecnymi w RNA i DNA jest występowanie uracylu (U) zamiast obecnej w DNA tyminy (T).
W wyniku połączenia wielu nukleotydów powstaje łańcuch polinukleotydowyłańcuch polinukleotydowy. Łączenie się nukleotydów następuje w wyniku reakcji dehydratacjidehydratacji. Sąsiadujące nukleotydy połączone są ze sobą wiązaniami 3',5'-fosfodiestrowymi, w których grupa fosforanowa przyłączona do węgla 5′ rybozy łączy się z węglem 3′ rybozy drugiego nukleotydu.
Grupy cukrowe i fosforanowe stanowią zewnętrzny szkielet RNA nazywany szkieletem cukrowo‑fosforanowym.
Dwa wolne końca polimeru różnią się od siebie. Na jednym końcu znajduje się reszta fosforanowa związana z węglem 5′, natomiast na drugim końcu grupa hydroksylowa przyłączona do węgla 3′. Stąd każdy łańcuch RNA wykazuje polarność budowy. Przyjęto, że sekwencję zasad zapisuje się w kierunku od końca 5′ łańcucha RNA do końca 3′, czyli w kierunku 5′→3′.
RNA jest zazwyczaj cząsteczką jednoniciową, która może tworzyć różnorodne struktury przestrzenne, takie jak struktura spinki do włosów.
RNA może przyjmować również postać dwuniciową. W tej formie występuje materiał genetyczny niektórych wirusów i wiroidów.
Występowanie dwóch rodzajów kwasów nukleinowych (nazwę zaproponował R. Altman w 1889 roku) zasugerowało odkrycie przez Phoebusa Levene’a rybozy w 1909 roku i deoksyrybozy 20 lat później. Na początku lat 30. XX wieku stwierdzono, że RNA i DNA wykazują różne właściwości w środowisku zasadowym i faktycznie stanowią odrębne klasy cząsteczek.
Indeks górny Źródło: Marta M. Gabryelska, Maciej Szymański, Jan Barciszewski, DNA – cząsteczka, która zmieniła naukę. Krótka historia odkryć, Nauka, 2009, 2, 111–134). Indeks górny koniecŹródło: Marta M. Gabryelska, Maciej Szymański, Jan Barciszewski, DNA – cząsteczka, która zmieniła naukę. Krótka historia odkryć, Nauka, 2009, 2, 111–134).
Rodzaje RNA
Wyróżnia się dwie grupy RNA – kodujące i niekodujące. RNA kodujący wchodzi w skład transkryptomutranskryptomu i obejmuje mRNA. Grupa niekodujących RNA, nazywanych również funkcjonalnymi RNA, zawiera wiele rodzajów RNA, m.in. rRNA, tRNA, snRNA, snoRNA, miRNA i siRNA. Pełnią one funkcję katalityczną i regulatorową podczas ekspresji genów.
Grupa RNA | Rodzaj RNA | Budowa i | Funkcja |
Kodujący – 4% całości RNA | mRNAmRNA | - zazwyczaj jednoniciowy - odcinki RNA powstałe w wyniku transkrypcjitranskrypcji odcinka DNA | - udział w biosyntezie białka |
Niekodujący/ – 96% całości | rRNArRNA | - możliwe występowanie | - udział w biosyntezie białek |
tRNAtRNA | - możliwe występowanie | - udział w translacjitranslacji | |
snRNAsnRNA | - obecny w jądrach | ||
snoRNAsnoRNA | - obecny w rejonie | - udział w chemicznej modyfikacji rRNA | |
miRNAmiRNA | - jednoniciowy - obecny u roślin, | - regulacja ekspresji genów poprzez hamowanie translacji | |
siRNAsiRNA | - dwuniciowy - obecny u roślin, | - regulacja ekspresji genów |
W jaki sposób sekwencja mRNA określa dane białko?
Aby z sekwencji DNA powstało białko, najpierw musi ona zostać przepisana na sekwencję RNA. Proces ten nazywany jest transkrypcją. W cząsteczce DNA jedna nić nazywana jest nicią kodującą, a druga nicią matrycową, i to właśnie na podstawie jej sekwencji powstaje cząsteczka RNA. Nić matrycowa odczytywana jest w kierunku 3' → 5', natomiast nowe cząsteczki RNA powstają w kierunku 5' → 3'. Oto przykład:
5'-ATGATCTCGTAA‑3' → sekwencja kodującej nici DNA
3'-TACTAGAGCATT‑5' → sekwencja matrycowej nici DNA
5'-AUGAUCUCGUAA‑3' → sekwencja nici mRNA
Transkrypcja RNA na matrycy DNA odbywa się na zasadzie komplementarności, jednak z powodu biochemicznej różnicy pomiędzy DNA i RNA, zamiast tyminy występuje uracyl.
Kwasy nukleinowe: RNA i DNA
RNA i DNA różnią się liczbą nici, składnikiem cukrowym, jedną z zasad oraz pełnioną funkcją.
RNA | DNA | ||
---|---|---|---|
Pełna nazwa | kwas rybonukleinowy | kwas deoksyrybonukleinowy | |
Funkcja | - nośnik informacji genetycznej | - nośnik informacji genetycznej | |
Liczba nici | 1 | 2 | |
Nukleotyd | Cukier | pentoza – ryboza | pentoza – deoksyryboza |
Zasady azotowe | - adenina | - adenina | |
Grupa fosforanowa | jedna grupa fosforanowa | jedna grupa fosforanowa |
Więcej na temat budowy i składu chemicznego DNA i RNA w e‑materiale pt. Struktura przestrzenna DNA i RNA.
Więcej o właściwościach katalitycznych RNA w e‑materiale pt. Rybozymy – RNA o właściwościach katalitycznychRybozymy – RNA o właściwościach katalitycznych.
Więcej o tRNA w e‑materiałach pt. Budowa i funkcje tRNA i rybosomówBudowa i funkcje tRNA i rybosomów i Aminoacylacja tRNAAminoacylacja tRNA.
Więcej o drobnoczęstoczkowych RNA w e‑materiale pt. Rola drobnocząsteczkowych RNA w regulacji ekspresji genówRola drobnocząsteczkowych RNA w regulacji ekspresji genów.
Słownik
reakcja chemiczna, w której wyniku z jednej lub jednocześnie z dwóch cząsteczek związku chemicznego zostaje usunięta cząsteczka wody
odcinek genu niekodujący sekwencji aminokwasów w polipeptydzie; rozdziela eksony w genach komórek eukariotycznych
wiele nukleotydów połączonych ze sobą wiązaniami fosfodiestrowymi
ang. messenger RNA – RNA informacyjny
ang. microRNA – mikroRNA
ang. short interfering RNA – mały interferujący RNA
ang. small nuclear RNA – mały jądrowy RNA
ang. small nucleolar RNA – mały jąderkowy RNA
ang. ribosomal RNA – RNA rybosomowy
ang. transfer RNA – RNA transportujący
podstawowa jednostka budowy (monomer) kwasów nukleinowych; pochodna nukleozydu, w której grupa hydroksylowa (–OH) części cukrowej jest połączona z cząsteczką kwasu fosforowego wiązaniem estrowym
związek organiczny zbudowany z zasady azotowej połączonej wiązaniem N-glikozydowym z pentozą
pięciowęglowy cukier występujący w RNA
cząsteczki kwasów rybonukleinowych (RNA) o właściwościach katalitycznych
proces obróbki pierwotnego produktu transkrypcji prekursorowego RNA (preRNA); polega na wycinaniu odcinków RNA niekodujących białka (intronów) i łączeniu we właściwej kolejności odcinków kodujących (egzonów); w procesie tym nieciągła informacja genetyczna zawarta w DNA zostaje przekształcona w ciągłą
(łac. transcriptio – przepisywanie) proces syntezy RNA, podczas którego na matrycy DNA syntetyzowana jest komplementarna nić mRNA
pula cząsteczek mRNA obecnych w określonym momencie w komórce lub organizmie
drugi etap biosyntezy białka, podczas którego, na podstawie informacji zapisanej w nici mRNA, syntetyzowany jest polipeptyd