bg‑blue

Budowa RNA

RNA, czyli kwas rybonukleinowy, tak samo jak DNA, zbudowany jest z długich, nierozgałęzionych łańcuchów polinukleotydowych, złożonych z wielu nukleotydównukleotydnukleotydów.

W skład nukleotydów tworzących RNA wchodzą następujące elementy:

  1. NukleozydnukleozydNukleozyd zbudowany z jednej z zasad azotowych (adeniny, cytozyny, guaniny lub uracylu) połączonej z pierwszym atomem węgla (1′) pięciowęglowego cukru rybozyrybozarybozy wiązaniem N‑glikozydowym.

  2. Grupa fosforanowa połączona z nukleozydem wiązaniem estrowym.

Zapamiętaj!

Jedną z różnic pomiędzy nukleotydami obecnymi w RNA i DNA jest występowanie uracylu (U) zamiast obecnej w DNA tyminy (T).

RBnpOflFaIUzx
Zasady purynowe występujące w RNA.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
R1AdyljGVPC8q
Zasady pirymidynowe występujące w RNA.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
RfXHEPrc2dE9z
Ilustracja interaktywna przedstawiająca budowę DNA. Składa się ona z następujących elementów: 1. Zasady azotowej. 2. Grupy fosforanowej. 3. Rybozy. 4. Wiązania estrowego. 5. Wiązania N-glikozydowego.
Budowa nukleotydu.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.

W wyniku połączenia wielu nukleotydów powstaje łańcuch polinukleotydowyłańcuch polinukleotydowyłańcuch polinukleotydowy. Łączenie się nukleotydów następuje w wyniku reakcji dehydratacjidehydratacjadehydratacji. Sąsiadujące nukleotydy połączone są ze sobą wiązaniami 3',5'-fosfodiestrowymi, w których grupa fosforanowa przyłączona do węgla 5′ rybozy łączy się z węglem 3′ rybozy drugiego nukleotydu.

Ważne!

Grupy cukrowe i fosforanowe stanowią zewnętrzny szkielet RNA nazywany szkieletem cukrowo‑fosforanowym.

RefxSD61ubQdf
Ilustracja interaktywna przedstawiająca strukturę przestrzenną RNA. Posiada ona 1. szkielet cukrowo-fosforanowy oraz 2. zasady azotowe.
Struktura przestrzenna RNA.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.

Dwa wolne końca polimeru różnią się od siebie. Na jednym końcu znajduje się reszta fosforanowa związana z węglem 5′, natomiast na drugim końcu grupa hydroksylowa przyłączona do węgla 3′. Stąd każdy łańcuch RNA wykazuje polarność budowy. Przyjęto, że sekwencję zasad zapisuje się w kierunku od końca 5′ łańcucha RNA do końca 3′, czyli w kierunku 5′→3′.

RNA jest zazwyczaj cząsteczką jednoniciową, która może tworzyć różnorodne struktury przestrzenne, takie jak struktura spinki do włosów.

RNA może przyjmować również postać dwuniciową. W tej formie występuje materiał genetyczny niektórych wirusów i wiroidów.

bg‑gray2
Dla zainteresowanych

Występowanie dwóch rodzajów kwasów nukleinowych (nazwę zaproponował R. Altman w 1889 roku) zasugerowało odkrycie przez Phoebusa Levene’a rybozy w 1909 roku i deoksyrybozy 20 lat później. Na początku lat 30. XX wieku stwierdzono, że RNA i DNA wykazują różne właściwości w środowisku zasadowym i faktycznie stanowią odrębne klasy cząsteczek.

Indeks górny Źródło: Marta M. Gabryelska, Maciej Szymański, Jan Barciszewski, DNA – cząsteczka, która zmieniła naukę. Krótka historia odkryć, Nauka, 2009, 2, 111–134). Indeks górny koniec

bg‑blue

Rodzaje RNA

Wyróżnia się dwie grupy RNA – kodujące i niekodujące. RNA kodujący wchodzi w skład transkryptomutranskryptomtranskryptomu i obejmuje mRNA. Grupa niekodujących RNA, nazywanych również funkcjonalnymi RNA, zawiera wiele rodzajów RNA, m.in. rRNA, tRNA, snRNA, snoRNA, miRNA i siRNA. Pełnią one funkcję katalityczną i regulatorową podczas ekspresji genów.

Grupa RNA

Rodzaj RNA

Budowa i 
występowanie

Funkcja

Kodujący

– 4% całości RNA

mRNAmRNAmRNA

- zazwyczaj jednoniciowy

- odcinki RNA powstałe w wyniku transkrypcjitranskrypcjatranskrypcji odcinka DNA

- udział w biosyntezie białka
- przenoszenie informacji genetycznej

Niekodujący/
funkcjonalny

– 96% całości
RNA

rRNArRNArRNA

- możliwe występowanie
fragmentów dwuniciowych
- najliczniejszy w komórce

- udział w biosyntezie białek
- składnik rybosomów, na
których zachodzi synteza białek

tRNAtRNAtRNA

- możliwe występowanie
fragmentów dwuniciowych
- obecny we
wszystkich
organizmach

- udział w translacjitranslacjatranslacji
- dostarczanie aminokwasów do rybosomu

snRNAsnRNAsnRNA

- obecny w jądrach
komórkowych
wszystkich eukariotów i archeonów

- udział w splicingusplicingsplicingu (wycinaniu intronówintronintronów)

snoRNAsnoRNAsnoRNA

- obecny w rejonie
jąderka w jądrach
komórkowych
eukariotów

- udział w chemicznej modyfikacji rRNA
- kierowanie potranskrypcyjnymi modyfikacjami rybosomalnych RNA (rRNA) i małych jądrowych RNA (snRNA)

miRNAmiRNAmiRNA

- jednoniciowy

- obecny u roślin,
kręgowców i
bezkręgowców

- regulacja ekspresji genów poprzez hamowanie translacji

siRNAsiRNAsiRNA

- dwuniciowy

- obecny u roślin,
kręgowców i
bezkręgowców

- regulacja ekspresji genów

bg‑blue

W jaki sposób sekwencja mRNA określa dane białko?

Aby z sekwencji DNA powstało białko, najpierw musi ona zostać przepisana na sekwencję RNA. Proces ten nazywany jest transkrypcją. W cząsteczce DNA jedna nić nazywana jest nicią kodującą, a druga nicią matrycową, i to właśnie na podstawie jej sekwencji powstaje cząsteczka RNA. Nić matrycowa odczytywana jest w kierunku 3' → 5', natomiast nowe cząsteczki RNA powstają w kierunku 5' → 3'. Oto przykład:

5'-ATGATCTCGTAA‑3' → sekwencja kodującej nici DNA
3'-TACTAGAGCATT‑5' → sekwencja matrycowej nici DNA

5'-AUGAUCUCGUAA‑3' → sekwencja nici mRNA

Transkrypcja RNA na matrycy DNA odbywa się na zasadzie komplementarności, jednak z powodu biochemicznej różnicy pomiędzy DNA i RNA, zamiast tyminy występuje uracyl.

bg‑blue

Kwasy nukleinowe: RNA i DNA

RNA i DNA różnią się liczbą nici, składnikiem cukrowym, jedną z zasad oraz pełnioną funkcją.

RNA

DNA

Pełna nazwa

kwas rybonukleinowy

kwas deoksyrybonukleinowy

Funkcja

- nośnik informacji genetycznej
- odczytywanie informacji genetycznej
- udział w syntezie białek
- katalizowanie reakcji biochemicznych (rybozymyrybozymrybozymy)
- udział w regulacji ekspresji genów

- nośnik informacji genetycznej

Liczba nici

1

2

Nukleotyd

Cukier

pentoza – ryboza

pentoza – deoksyryboza

Zasady azotowe

- adenina
- uracyl
- cytozyna
- guanina

- adenina
- tymina
- cytozyna
- guanina

Grupa fosforanowa

jedna grupa fosforanowa

jedna grupa fosforanowa

Więcej na temat budowy i składu chemicznego DNA i RNA w e‑materiale pt. Struktura przestrzenna DNA i RNA.

Więcej o właściwościach katalitycznych RNA w e‑materiale pt. Rybozymy – RNA o właściwościach katalitycznychPmfnVWswHRybozymy – RNA o właściwościach katalitycznych.

Więcej o tRNA w e‑materiałach pt. Budowa i funkcje tRNA i rybosomówPpopVErLYBudowa i funkcje tRNA i rybosomówAminoacylacja tRNAPMBRDKBD5Aminoacylacja tRNA.

Więcej o drobnoczęstoczkowych RNA w e‑materiale pt. Rola drobnocząsteczkowych RNA w regulacji ekspresji genówPF6sod9BmRola drobnocząsteczkowych RNA w regulacji ekspresji genów.

Słownik

dehydratacja
dehydratacja

reakcja chemiczna, w której wyniku z jednej lub jednocześnie z dwóch cząsteczek związku chemicznego zostaje usunięta cząsteczka wody

intron
intron

odcinek genu niekodujący sekwencji aminokwasów w polipeptydzie; rozdziela eksony w genach komórek eukariotycznych

łańcuch polinukleotydowy
łańcuch polinukleotydowy

wiele nukleotydów połączonych ze sobą wiązaniami fosfodiestrowymi

mRNA
mRNA

ang. messenger RNA – RNA informacyjny

miRNA
miRNA

ang. microRNA – mikroRNA

siRNA
siRNA

ang. short interfering RNA – mały interferujący RNA

snRNA
snRNA

ang. small nuclear RNA – mały jądrowy RNA

snoRNA
snoRNA

ang. small nucleolar RNA – mały jąderkowy RNA

rRNA
rRNA

ang. ribosomal RNA – RNA rybosomowy

tRNA
tRNA

ang. transfer RNA – RNA transportujący

nukleotyd
nukleotyd

podstawowa jednostka budowy (monomer) kwasów nukleinowych; pochodna nukleozydu, w której grupa hydroksylowa (–OH) części cukrowej jest połączona z cząsteczką kwasu fosforowego wiązaniem estrowym

nukleozyd
nukleozyd

związek organiczny zbudowany z zasady azotowej połączonej wiązaniem N-glikozydowym z pentozą

ryboza
ryboza

pięciowęglowy cukier występujący w RNA

rybozym
rybozym

cząsteczki kwasów rybonukleinowych (RNA) o właściwościach katalitycznych

splicing
splicing

proces obróbki pierwotnego produktu transkrypcji prekursorowego RNA (preRNA); polega na wycinaniu odcinków RNA niekodujących białka (intronów) i łączeniu we właściwej kolejności odcinków kodujących (egzonów); w procesie tym nieciągła informacja genetyczna zawarta w DNA zostaje przekształcona w ciągłą

transkrypcja
transkrypcja

(łac. transcriptio – przepisywanie) proces syntezy RNA, podczas którego na matrycy DNA syntetyzowana jest komplementarna nić mRNA

transkryptom
transkryptom

pula cząsteczek mRNA obecnych w określonym momencie w komórce lub organizmie

translacja
translacja

drugi etap biosyntezy białka, podczas którego, na podstawie informacji zapisanej w nici mRNA, syntetyzowany jest polipeptyd