Transkrypcja jest pierwszym etapem ekspresji genu. Zachodzi w jądrze komórkowym. Polega na zsyntetyzowaniu łańcucha RNA na podstawie informacji genetycznej zawartej w cząsteczce DNA. Proces ten jest możliwy dzięki zasadzie komplementarnościzasada komplementarnościzasadzie komplementarności.

Podwójna helisa DNA składa się z dwóch nici komplementarnych względem siebie: nici kodującej i nici matrycowej. Nić matrycowa to nić transkrybowana, która stanowi szablon dla sekwencji nukleotydów transkryptu RNA. Nić kodująca nie ulega transkrypcji – jej sekwencja, podobnie jak sekwencja powstającego mRNA, jest komplementarna do nici matrycowej, z tą różnicą, że w RNA zamiast nukleotydów zawierających tyminę występują nukleotydy z uracylem.

RZzX1YmDNXCSk1
Synteza mRNA na bazie nici matrycowej DNA.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.

Genom człowieka składa się z ponad 3 miliardów par nukleotydów. Około 70% DNA człowieka to materiał pozagenowy. Pozostałe 30% tworzy geny – jednostki, które podlegają transkrypcji. Zawierają one informację o budowie łańcucha polipeptydowego lub kwasu nukleinowego.

U eukariontów geny mają budowę nieciągłągeny nieciągłenieciągłą: DNA, który je tworzy, składa się z fragmentów kodujących – eksonów (egzonów) i niekodujących – intronów. W procesie transkrypcji przepisywane są zarówno fragmenty kodujące, jak i niekodujące, w wyniku czego powstaje pre‑mRNApre‑mRNApre‑mRNA. Każdy gen wyznaczany jest przez dwie struktury graniczne: promotorpromotorpromotor oraz sekwencję sygnału poliadenylacjipoliadenylacjapoliadenylacji.

Ważne!

Enzymem katalizującym przebieg transkrypcji jest polimeraza RNA zależna od DNApolimeraza RNA zależna od DNApolimeraza RNA zależna od DNA.

Człowiek i inne organizmy eukariotyczne mają trzy rodzaje polimerazy RNA: I, II i III. Każdy specjalizuje się w transkrypcji określonych klas genów:

  • Polimeraza RNA I odpowiada za syntezę pre‑rRNA, który jest przekształcany w rRNA współtworzący rybosomy. Polimeraza RNA I działa jedynie w obrębie jąderka.

  • Polimeraza RNA II odpowiada za transkrypcję pozostałych genów. Wskutek jej działalności powstaje pre‑mRNA. Syntetyzuje ona również enzymatyczny snRNAsnRNAsnRNA, który jest wykorzystywany w dalszej obróbce pre‑mRNA.

  • Polimeraza RNA III odpowiada za syntezę tRNA.

Rośliny mają dodatkowe dwa rodzaje polimerazy RNA: IV i V, które biorą udział w syntezie małych RNA.

Więcej o budowie DNA i zasadzie komplementarności w e‑materiale pt. Skład chemiczny i funkcje DNAPJo4OIU2rSkład chemiczny i funkcje DNA.

bg‑azure

Etapy transkrypcji

RhexWl46QS44C
Wybierz jedno nowe słowo poznane podczas dzisiejszej lekcji i ułóż z nim zdanie.
R1KRJIGczg5MM1
Schemat przedstawiający przebieg transkrypcji eukariotycznej.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
bg‑lime

Inicjacja

Wszystkie rodzaje polimeraz komórki eukariotycznej wymagają obecności specjalnych białek, które umożliwiają rozpoczęcie transkrypcji. W pierwszej kolejności ogólne czynniki transkrypcyjne, czyli takie białka, które biorą udział w inicjowaniu transkrypcji wszystkich genów, wiążą się z promotorem. Polimeraza nie rozpoznaje sekwencji nukleotydów samego promotora, ale przyłącza się do kompleksu złożonego z czynników transkrypcyjnych i kwasu nukleinowego. Tworzy się w ten sposób kompleks inicjacyjnytranskrypcyjny kompleks inicjacyjnykompleks inicjacyjny, który umożliwia pierwszy etap transkrypcji – inicjację. Niektóre promotory – 10 do 25 par zasad przed miejscem inicjacji (punktem startowym, którym jest sekwencja ATG na nici kodującej) – zawierają tzw. kasetę TATA, która przybiera postać 5'-TATAAA- 3'. Z kasetą łączy się m.in. specyficzne białko TBP (ang. TATA‑binding protein), co umożliwia rozpoczęcie syntezy RNA. Sekwencje DNA z większą liczbą par zasad T i A są łatwiej rozplatane przez polimerazę, gdyż zawierają podwójne (a nie potrójne, jak między G i C) wiązania wodorowe. Polimeraza przyłącza się do końca 3' nici matrycowej i przesuwa się w kierunku 5', a syntezowana przez nią nić RNA powstaje od końca 5' do końca 3'.

RjAedHmg9ZDjg1
Białko TBP, czyli białko wiążące element TATA, rozpoznaje sekwencję TATA i wiąże się z nią, wyznaczając miejsce startu transkrypcji.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
bg‑lime

Elongacja

Po rozpleceniu helisy DNA przez helikazęhelikazahelikazę rozpoczyna się kolejny etap transkrypcji – elongacja. Polega ona na wydłużaniu powstającego łańcucha RNA przez przesuwającą się względem DNA polimerazę. Polimeraza przesuwa się po nici DNA od końca 3′ w kierunku końca 5′, a pre‑mRNA jest syntetyzowany w kierunku od 5′ do 3′.

Ważne!

Transkrypcja jest procesem endoenergetycznym. Energii niezbędnej do syntezy łańcucha RNA dostarczają wysokoenergetyczne wiązania w ATP, GTP, CTP oraz UTP.

Różne klasy polimeraz RNA zależnych od DNA biorą udział w transkrypcji różnych regionów DNA, popełniają błędy z różną częstotliwością, ponadto nie każda polimeraza ma właściwości naprawcze, tzn. jest w stanie je korygować.

bg‑lime

Terminacja

Terminacja, czyli zakończenie transkrypcji, rozpoczyna się po zsyntetyzowaniu przez polimerazę sekwencji sygnału poliadenylacji AAUAAA na mRNA. Fragment ten jest od razu wiązany przez odpowiednie białka, uwalniające nowo powstały transkrypt od polimerazy, która następnie odłącza się od DNA.

Nowo powstały transkrypt musi przejść proces dojrzewania (obróbki potranskrypcyjnej).

Więcej o modyfikacjach potranskrypcyjnych RNA w e‑materiale pt. Modyfikacje potranskrypcyjne RNA u EucaryotaD19tzc3XbModyfikacje potranskrypcyjne RNA u Eucaryota.

Słownik

geny nieciągłe
geny nieciągłe

geny składające się z sekwencji kodujących (eksonów) i sekwencji niekodujących (intronów); występują u eukariontów i archeonów

helikaza
helikaza

enzym rozplatający podwójną helisę DNA lub RNA, dwuniciową strukturę utrzymywaną przez wiązania wodorowe komplementarnych zasad azotowych

poliadenylacja
poliadenylacja

potranskrypcyjne dołączanie 40–200 reszt adeninowych (sekwencja poliA) do nowo zsyntetyzowanego łańcucha mRNA organizmów eukariotycznych

polimeraza RNA zależna od DNA
polimeraza RNA zależna od DNA

enzym syntezujący nić RNA na matrycy DNA w procesie transkrypcji

pre‑mRNA
pre‑mRNA

cząsteczka RNA powstała w wyniku procesu transkrypcji, zawierająca kodujące (eksony) oraz niekodujące (introny) sekwencje nukleotydów

promotor
promotor

odcinek DNA leżący przed genem, zawierający sekwencje rozpoznawane przez polimerazę RNA zależną od DNA lub czynniki transkrypcyjne ułatwiające przyłączenie się polimerazy RNA; po połączeniu się polimerazy RNA z promotorem rozpoczyna się proces syntezy RNA, czyli transkrypcja

snRNA
snRNA

(ang. small nuclear RNA) niskocząsteczkowy jądrowy kwas rybonukleinowy; jeden z rodzajów kwasów rybonukleinowych, pełniący funkcję rybozymu katalizującego proces wycinania intronów

transkrypcyjny kompleks inicjacyjny
transkrypcyjny kompleks inicjacyjny

kompleks białek niezbędny do rozpoczęcia transkrypcji genów kodujących białka, składający się z polimerazy RNA oraz ogólnych czynników transkrypcyjnych

zasada komplementarności
zasada komplementarności

zasada, zgodnie z którą zasady azotowe nukleotydów kwasów nukleinowych łączą się jedynie w określonych konfiguracjach – adenina z tyminą (w DNA), adenina z uracylem (w RNA) i cytozyna z guaniną