bg‑azure

Teorie biogenezy

Biogeneza (z gr. bíos – życie, génesis – pochodzenie, stawanie się), czyli pochodzenie życia na Ziemi, to jedno z najtrudniejszych i do dzisiaj nie w pełni rozwikłanych zagadnień biologii. Na jej temat powstały liczne hipotezy.

Współczesna dyskusja nad zagadnieniem powstania życia została zapoczątkowana w połowie XIX w., kiedy Ludwik Pasteur uznał za bezpodstawną koncepcję samorództwa (abiogenezy), czyli spontanicznego powstawania organizmów żywych z materii nieożywionej. Pasteur udowodnił, że nawet niewielkie organizmy, takie jak bakterie, „rodzą się” z podobnych do nich rodziców. Jego prace nie dały jednak odpowiedzi na istotne pytanie: Jak powstały pierwsze osobniki każdego gatunku?

Żadna z koncepcji dotyczących biogenezy nie zyskała powszechnej akceptacji. Wiadomo jedynie to, że życie powstało ok. 4 mld lat temu w warunkach beztlenowych (tlen jest pochodzenia biologicznego) i że powstało tylko raz, zmieniając zarazem pierwotne warunki na Ziemi w tak dużym stopniu, że późniejsza biogeneza była już niemożliwa.

Zapis kopalny nie dostarcza bezpośrednich świadectw na powstanie życia, pokazuje jednak, że najdawniejsze żywe organizmy pojawiły się przed co najmniej 3,5 mld lat (pierwsze stromatolity i kopalne struktury bakteryjne), a być może nawet przed 3,8 mld lat (węgiel o składzie izotopowym sugerującym biologiczne pochodzenie).

bg‑gray3

Hipoteza o pozaziemskim pochodzeniu życia

Obecność materii organicznej w meteorytach i pyle kosmicznym skłania do założenia, że pierwsze etapy biogenezy nie musiały być ograniczone do Ziemi. Dlatego jedną z koncepcji dotyczących biogenezy jest hipoteza o pozaziemskim pochodzeniu życia.

W 1908 r. Svante Arrhenius sformułował hipotezę panspermiipanspermiapanspermii, mówiącą, że życie rozprzestrzenia się w kosmosie dzięki bakteriom, które przemieszczają się pod wpływem ciśnienia światła.

W roku 1986 brytyjski astrofizyk Fred Hoyle wysunął tezę, że życie na Ziemi mogło powstać w warunkach, które panują w przestrzeni kosmicznej, i dopiero stamtąd zostało przeniesione na Ziemię przez komety.

R1B1AvYaBcP3e1
Fragment meteorytu Murchison w Narodowym Muzeum Historii Naturalnej w Waszyngtonie.
Źródło: Basilicofresco, Wikimedia Commons, licencja: CC BY-SA 3.0.

Poparciem dla hipotezy o pozaziemskim pochodzeniu życia są m.in.:

  • wykrycie glicyny w obłokach materii międzygwiazdowej;

  • odkrycie kilkunastu aminokwasów i zasad azotowych w meteorycie Murchison, który spadł w Australii w 1969 r.;

  • eksperymenty laboratoryjne, które dowodzą, że w warunkach przestrzeni kosmicznej może zachodzić synteza zasad purynowych i pirymidynowych, czyli głównych składowych DNA i RNA.

Francis Crick, jeden z odkrywców struktury DNA, w 1973 r. w artykule Directed panspermia wysunął hipotezę, że życie zostało świadomie przeniesione z kosmosu na Ziemię przez wysoko zorganizowaną cywilizację.

bg‑gray3

Hipoteza Oparina–Haldane’a

W 1924 r. rosyjski biochemik Aleksandr Oparin przedstawił scenariusz pojawienia się życia na Ziemi, zakładający, że powstało ono z prostych związków organicznych, gromadzących się w pierwotnym oceanie.

Oparin postulował, że związki te mogły utworzyć koacerwatkoacerwatkoacerwat, czyli koloidalną zawiesinę pęcherzykowatych struktur, które miały być prekursorami komórek. Sam eksperymentował z koacerwatami wytwarzanymi w środowisku wodnym z żelatyny i gumy arabskiej.

W 1929 r. brytyjski biolog John Haldane przedstawił taką samą hipotezę, zgodnie z którą w beztlenowej, redukującej atmosferze bogatej w dwutlenek węgla, metan, siarkowodór, parę wodną i wodór, w obecności ultrafioletu i wyładowań elektrycznych, z wodoru oraz związków azotu i węgla mogą powstać monomery i polimery organiczne.

Haldane zakładał, że mieszanina związków chemicznych, którą nazwał „zupą pierwotnązupa pierwotnazupą pierwotną”, została podzielona na kropelki odizolowane błonami lipidowymi.

RG6tgZxWWqNBT

Według koncepcji Oparina i Haldane’a pierwsze organizmy były cudzożywne i dopiero po zużyciu wszystkich substancji odżywczych z „zupy pierwotnej” narodziły się organizmy samożywne.

bg‑gray3

Eksperyment Millera i Ureya

W 1953 r. eksperymentalnej weryfikacji hipotezy Oparina–Haldane’a dokonali Stanley Miller i Harold UreyUniversity of Chicago.

RvANyXQrfnATZ

Doświadczenie polegało na przepuszczaniu iskier elektrycznych przez mieszaninę gazów: pary wodnej, metanu, amoniakuwodoru. Po tygodniowym eksperymencie powstała mieszanina związków organicznych, zawierająca 5 aminokwasów (glicynę, alfa‑alaninę, beta‑alaninę, kwas asparaginowy, kwas alfa‑aminomasłowy), mocznik, proste kwasy tłuszczowe i węglowodany. Wyniki doświadczenia opublikowano w 1953 r. w czasopiśmie naukowym „Science”.

Rjaz4G9Rhmbbi
Ilustracja interaktywna ukazuje schematyczną budowę aparatu Millera. Aparatura składa się z układu dwóch kulistych kolb szklanych. Jedna kolba wypełniona jest częściowo wodą - znajduje się niżej w układzie, druga - znajdująca się wyżej - zawiera elektrody oraz substancje wyjściowe: wodę, metan, amoniak i wodór. Para z podgrzewanej, za pomocą płaszcza grzewczego, kolby dolnej miesza się z doprowadzanymi z zewnątrz gazami, następnie poddawana jest działaniu wyładowań elektrycznych w górnym naczyniu. Po schłodzeniu w chłodnicy (znajdującej się tuż pod górną kolbą) powracała do pierwszego naczynia, przechodząc przez syfon zawierający skroplone związki organiczne oraz miejsce pobierania próbki.
Aparat Millera zbudowany jest z:
– reaktora (1), w którym prąd o napięciu 60 000 V (2) wytwarza iskry elektryczne;
– chłodnicy (3), w której gazowe produkty reakcji ulegają skropleniu;
– syfonu (4), w którym znajdują się skroplone związki organiczne;
– kolby (5), podgrzewanej przez płaszcz grzewczy (6), w której wytwarzana jest para wodna;
– miejsca odbierania próbek (7).
W pierwszym i drugim doświadczeniu jako substratu (oprócz wody) używano mieszaniny gazów: wodoru, metanu i amoniaku, pod ciśnieniami parcjalnymi 100, 200 i 300 mm Hg. W kolejnym doświadczeniu mieszanina składała się z wodoru, metanu i azotu.
Źródło: YassineMrabet, Wikimedia Commons, licencja: CC BY-SA 3.0.

Najpoważniejsze trudności, jakie napotyka teoria to brak efektywnego mechanizmu naturalnego prowadzącego do znacznej koncentracji produktów samorzutnej syntezy związków organicznych oraz brak mechanizmu dziedziczenia informacji aż do czasu syntezy pierwszych kwasów nukleinowych.

Więcej na temat eksperymentu Millera‑Ureya w e‑materiale: Powstanie życia.

bg‑gray3

Inne alternatywne lub uzupełniające hipotezy

W 1965 r. Amerykanin Sidney Walter Fox wykazał doświadczalnie, że w wysokiej temperaturze i specjalnych warunkach fizykochemicznych towarzyszących wulkanom aminokwasy tworzą „mikrosferymikrosferamikrosfery”, przypominające właściwościami komórki. W 1969 r. Fox wykazał, że pod wpływem ciepła tworzą się polimery aminokwasowe. Stwierdził, że podgrzewanie mieszaniny aminokwasów w temperaturze wyższej niż 100°C sprzyja powstaniu krótkich i długich peptydów. Na tej podstawie wysunął wniosek, iż w rozgrzanych gazach czynnych wulkanów zawierających amoniak, metan i parę wodną mogło dojść do wytworzenia aminokwasów, które uległyby później polimeryzacji do polipeptydów.

W 1967 r. irlandzki naukowiec John Desmond Bernal wystąpił z tezą, że związki organiczne koncentrowały się w pianie na powierzchni wody morskiej, a pierwsze protoorganizmy powstały w ujściach rzek, gdzie minerały ilaste służyły jako powierzchnie katalizujące dalszą koncentrację, a potem ewolucję pierwotnego życia. Badania potwierdziły zdolność iłów do adsorpcji związków organicznych.

Teorię tę rozbudował w 1985 r. Brytyjczyk Alexander Graham Cairns‑Smith, według którego struktura krystaliczna minerałów ilastychminerały ilasteminerałów ilastych była nośnikiem informacji dziedzicznej, a kwasy nukleinowe przejęły tę funkcję dopiero później, dzięki obecności wysoko zorganizowanych enzymów białkowych.

W 1985 r. amerykański naukowiec Freeman John Dyson zwrócił uwagę na to, że odpowiedzialne za metabolizm białka i DNA powstały niezależnie i dopiero później połączyły się, tworząc pierwotne organizmy.

W 2017 r. Matthew Dodd, Dominic Papineau, Tor Grenne, John Slack, Martin Rittner, Franco Pirajno, Jonathan O'NeilCrispin Little opublikowali artykuł Evidence for early life in Earth's oldest hydrothermal vent precipitates, w którym wysunęli hipotezę, że życie powstało co najmniej 3,77 mld lat temu na głębokim dnie oceanu, w obrębie tzw. oaz ryftowychoazy ryftoweoaz ryftowych.

bg‑gray3

Świat RNA

W 1967 r. Carl Woese wysunął hipotezę mówiącą, że RNA ma dwojakie właściwości:

  • jest nośnikiem informacji genetycznej;

  • jest katalizatorem reakcji.

W 1968 r. Woese'a poparli brytyjscy biochemicy Francis CrickLeslie Eleazer Orgel.

R1SYNKRjdqqhF

Pierwszych dowodów na to, że cząsteczki RNA mają aktywność katalityczną, dostarczył w 1981 r. Thomas Cech, który odkrył, że introny z pewnych prekursorowych RNA wycinają się same, co oznacza, że proces ten jest autokatalityczny i przebiega bez udziału białek. To odkrycie przemawia za tym, że pierwszą „żywą cząsteczką” mogła być replikaza RNA, zdolna do katalizowania swojej własnej replikacji bez pomocy białka. Cząsteczki RNA, działające jak enzymy, nazwano rybozymamirybozymyrybozymami.

W 1986 r. Walter Gilbert nazwał teorię mówiącą, że życie na Ziemi zaczęło się od cząsteczek RNA, światem RNA. Założenia tej teorii są następujące:

  1. Cząsteczki RNA przejawiające aktywność katalityczną wykorzystują tę zdolność i w „zupie pierwotnej” budują same siebie.

  2. Autoreplikujące się cząsteczki RNA na zasadzie rekombinacji i mutacji ewoluują w kierunku wytwarzania nowych funkcji i opanowywania nowych nisz.

  3. Molekuły RNA rozwijają szereg właściwości enzymatycznych.

  4. Molekuły RNA zaczynają syntetyzować białka, które są lepszymi od nich enzymami, tzn. pełnią te same funkcje bardziej efektywnie.

  5. Powstające w ten sposób enzymy białkowe kodowane są przez tzw. ekson RNA (będący elementem współczesnego DNA).

  6. Pojawia się DNA, umożliwiając bezbłędne przechowywanie informacji genetycznej.

  7. RNA przestaje odgrywać główną rolę w ewolucji prebiotycznej (przed powstaniem życia), ustępując miejsca swoim własnym wytworom – białkom i DNA, które zdolne są do pełnienia w sposób bardziej efektywny tych funkcji, które RNA pełniło dotychczas niejako w ich zastępstwie.

Cząsteczki RNA spełniają wymogi cząsteczek, które mogły dać początek życiu, stąd hipoteza świata RNA ma wielu zwolenników.

Więcej na temat rybozymów w e‑materiale: Rybozymy – RNA o właściwościach katalitycznychPmfnVWswHRybozymy – RNA o właściwościach katalitycznych.

bg‑gray3

Ostatni uniwersalny wspólny przodek

Uniwersalność biochemii współczesnych organizmów (w szczególności kodu genetycznego) sugeruje, że życie na Ziemi powstało tylko raz. Oznacza to, że można mówić o ostatnim uniwersalnym wspólnym przodku (LUCA, z ang. last universal common ancestor) wszystkich żyjących obecnie form.

W latach 70. XX w. Carl Woese i jego współpracownicy dzięki badaniom rRNA opracowali ogólny schemat filogenetycznych pokrewieństw między wszystkimi organizmami. Wyodrębnili trzy domeny: Archaea, BacteriaEukaryota.

Naukowcy dokonali dużego postępu w badaniu filogenetycznych pokrewieństw między organizmami. Zsekwencjonowali całe genomy kilkudziesięciu tysięcy gatunków, co pozwoliło na wyciągnięcie wniosków na temat historii ewolucji, m.in. oszacowanie czasu dywergencji (różnicowania się w drodze ewolucji) poszczególnych linii ewolucyjnych, oraz na temat cech przodków obecnie żyjących organizmów.

Słownik

koacerwat
koacerwat

krople koloidalnych roztworów białek wykazujące najprostsze przejawy metabolizmu (pobieranie z otoczenia pewnych związków organicznych, zwiększanie rozmiarów i dzielenie się na mniejsze części); struktury opisane przez Aleksandra Oparina w jego teorii tłumaczącej proces powstawania życia na Ziemi; pierwsze struktury w dziejach Ziemi, w których zachodziły reakcje chemiczne porównywalne z reakcjami biochemicznymi, które doprowadziły do powstania życia

mikrosfera
mikrosfera

kulista struktura powstająca w wyniku interakcji wody z cząsteczkami tworzącymi się na drodze spontanicznej polimeryzacji aminokwasów, zwanymi proteinoidami; ma właściwości osmotyczne, niekiedy obserwowano występowanie na powierzchni mikrosfer zjawisk elektrycznych przypominających potencjał błonowy; w niektórych teoriach dotyczących pochodzenia życia na Ziemi mikrosfery przedstawiane są jako rodzaj protobiontów, form przedżywych, które miały ewoluować w kierunku pierwotnych komórek

minerały ilaste
minerały ilaste

minerały z grupy glinokrzemianów uwodnionych o strukturze warstwowej, tworzące skupienia złożone z drobnych, nierozpoznawalnych gołym okiem łusek; łatwo chłoną wodę, co powoduje ich pęcznienie i uplastycznienie; główne składniki skał ilastych i gleb

oazy ryftowe
oazy ryftowe

aktywne, wulkaniczne pęknięcia skorupy oceanicznej

panspermia
panspermia

(gr. pan – wszystko, sperma – nasienie) jedna z koncepcji powstania życia na Ziemi, głosząca, że materia żywa trafiła na Ziemię z kosmosu przypadkiem lub została przysłana przez jakąś wysoko zorganizowaną cywilizację; istnieje wiele odmian tej hipotezy, np. radiopanspermia mówiąca, że żywe cząstki mogą być transportowane dzięki promieniowaniu gwiazd, nekropanspermia, według której czynniki biologiczne po dotarciu na planetę mogą przyczynić się do powstania na niej życia, dzięki swojemu materiałowi genetycznemu; obecnie jest brana pod uwagę litopanspermia, czyli możliwość przenoszenia mikroorganizmów przez meteoryty, okazało się bowiem, że przetrwalniki bakterii mogą przeżyć w przestrzeni kosmicznej (przypadkowo zawleczone na aparaturę badawczą instalowaną na powierzchni Księżyca)

protobionty
protobionty

hipotetyczne, najprymitywniejsze formy życia sprzed powstania organizmów syntetyzujących białka i kwasy nukleinowe

rybozymy
rybozymy

cząsteczki kwasów rybonukleinowych (RNA) o właściwościach katalitycznych, zbliżonych do enzymów białkowych

zupa pierwotna
zupa pierwotna

hipotetyczna mieszanina związków organicznych, która według jednej z hipotez dała początek życiu na Ziemi