bg‑azure

Bakterie jako producenci materii organicznej

Jak wiesz, procesem uruchamiającym krążenie materii w ekosystemie jest zdolność producentów do fotosyntezy. To umiejętność wykorzystania energii słonecznej do produkcji związków organicznych z powszechnych w otoczeniu związków nieorganicznych: COIndeks dolny 2 i HIndeks dolny 2O. Producenci stanowią pokarm konsumentów, a reducenci, rozkładając ich szczątki, przywracają obieg materii.

Ciekawostka

Najmniejszy pełny ekosystem lądowy to odsłonięte skały tzw. pustyni Rossa na Antarktydzie. Na skałach tych występuje kilka gatunków porostów, a pod nimi żyją – chronione przed niską temperaturą – glony Hemichloris antarctica i sinice Chlorcoccidosora. Konsumentów reprezentuje grzyb, pasożytujący na porostach, a reducenci to kilka gatunków bakterii. Ekosystem jest zależny od światła i – mimo skrajnych warunków życia – produktywny (do 150 g biomasy na mIndeks górny 2).

Chemosynteza to słowo składające się z dwóch części: „chemo” oznacza związki chemiczne, a „synteza” to tworzenie czegoś. W tym przypadku chodzi o wytwarzanie związków organicznych (glukozy) z dwutlenku węgla i wody z wykorzystaniem tlenu i energii chemicznej. Źródłem energii w chemosyntezie jest zwykle cząsteczka, która ma wolny elektron i może go przekazać na łańcuch transportu elektronów (podobnie jak podczas fotosyntezy). Końcowym produktem transportu elektronów jest ATP – cząsteczka, której energia zostanie wykorzystana do syntezy cukrów, podobnie jak w fazie fotosyntezy niezależnej od światła (cykl Calvina). Ponieważ jest to reakcja mało wydajna energetycznie, z chemosyntezy nie mogą korzystać organizmy wielokomórkowe. Chemosynteza od fotosyntezy różni się tym, że źródłem energii do asymilacji dwutlenku węgla jest energia chemiczna powstała na skutek utleniania różnych związków.

RQ4FsgghtQ9cA1
Venenivibrio stagnispumantis to chemosyntetyzująca bakteria, czerpiąca energię użyteczną biologicznie do asymilacji dwutlenku węgla z utleniania wodoru, czyli z chemosyntezy. Szczepy bakterii izolowane są w gorącym źródle Champagne Pool w Nowej Zelandii.
Źródło: Adrian Hetzer, Wikimedia Commons, licencja: CC BY-SA 3.0.

Przebieg chemosyntezy można podzielić na dwie fazy:

  1. Przekształcenie energii w wyniku utleniania obecnych w środowisku substratów przy pomocy tlenu atmosferycznego i wytworzenie siły asymilacyjnej w postaci ATP (także NADH, NADPH). Można to zapisać jako:

    związek zredukowany + OIndeks dolny 2 → związek lub jon utleniony + ATP (energia).

  2. Asymilacja i redukcja dwutlenku węgla do związków organicznych z wykorzystaniem siły asymilacyjnej powstałej w pierwszej fazie:

    COIndeks dolny 2 + HIndeks dolny 2O + ATP (energia) → glukoza + OIndeks dolny 2.

Chemosynteza była prawdopodobnie pierwszym w dziejach życia procesem metabolicznymmetabolizmmetabolicznym. Podobnie jak fotosynteza, proces ten przekształca materię nieorganiczną w organiczną, co umożliwia krążenie pierwiastków w cyklach biogeochemicznych. Wielu naukowców uważa, że bakterie chemosyntetyzujące mogą występować poza Ziemią, np. na Marsie.

RHvIQeJSTTL641
Oliwiny to zielonawe krzemiany występujące w skałach magmowych, np. bazalcie. Naukowcy z Oregonu w tunelach lawowych w Górach Kaskadowych znaleźli bakterie, które pozyskują energię z utleniania zawartego w oliwinach żelaza. Proces ten zachodzi w bardzo niskiej temperaturze i przy małym dostępie tlenu, czyli w warunkach zbliżonych do panujących na Marsie. Ponieważ w skałach marsjańskich znaleziono ślady bakterii podobnych do tych z lawy, naukowcy przypuszczają, że na Marsie mogły żyć właśnie takie chemosyntetyzujące bakterie.
Źródło: Petr Hykš, Flickr, licencja: CC BY-NC-ND 2.0.
bg‑azure

Związek pomiędzy fotosyntezą i chemosyntezą

Wśród bakterii występują fotoautotrofy, które wykorzystują światło do produkcji pożywienia. Są to sinice, zielone i purpurowe bakterie siarkowe oraz bakterie purpurowe (nienależące do bakterii siarkowych). Jednak istnieją też bakterie, które do produkcji związków organicznych z dwutlenku węgla i wody używają nie energii słońca, a energii z reakcji utleniania różnych związków chemicznych. Nazywamy je chemoautotrofami i zaliczają się do nich bakterie siarkowe, żelazowe, wodorowe, metanogenne, nitryfikacyjne czy metanowe.

bg‑blue

Krążenie materii pomiędzy ekosystemami opartymi na fotosyntezie i chemosyntezie

RPIqYOA6fUgko1
Grafika przedstawia schemat zależności w krążeniu materii pomiędzy ekosystemami opartymi na fotosyntezie i chemosyntezie. Na pierwszym obrazku przedstawiono drzewa rosnące nad jeziorem oraz słońce. Światło słoneczne jest źródłem energii dla ekosystemów takich jak las. Rośliny, wykorzystując energię świetlną, wytwarzają związki organiczne w procesie fotosyntezy. Wytworzona w ten sposób materia organiczna jest zjadana przez zwierzęta. Gnijące szczątki i odchody są źródłem metanu i siarkowodoru. Siarkowodór i metan są uwalniane także przez kominy hydrotermalne w morskich głębinach oraz zimne wycieki. Bakterie chemosyntetyzujące produkują związki organiczne bez udziału światła, z wykorzystaniem energii chemicznej. Chemosymbiotyczne zwierzęta (np. małże, rurkoczułkowce) pobierają związki organiczne od chemosyntetyzujących mikroorganizmów, które żyją w ich ciele. Ptaki, ryby i inne zwierzęta zjadają organizmy chemosymbiotyczne.
Rośliny, wykorzystując energię słoneczną, produkują związki organiczne w procesie fotosyntezy. Są one zjadane i wykorzystywane przez zwierzęta. Ptaki, ryby i inni przedstawiciele królestwa zwierząt mogą się też żywić chemosymbiontami. Podczas rozkładu (gnicia) martwej materii powstają gazy: siarkowodór i metan. Gazy te są także wydzielane przez kominy hydrotermalne. Bakterie chemosyntetyzujące produkują związki organiczne z użyciem energii chemicznej, a część z nich żyje w symbiozie z organizmami dennymi: rurkoczułkowcami i małżami. W ten sposób dochodzi do krążenia materii pomiędzy ekosystemami opartymi na fotosyntezie i tymi opartymi na chemosyntezie.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
bg‑azure

Rodzaje bakterii chemosyntetyzujących

Bakterie chemosyntetyzujące można podzielić na dwie grupy:

  1. Litotrofy, czyli bakterie, które jako źródło energii wykorzystują związki nieorganiczne: siarki, azotu, żelaza i wodoru.

  2. Organotrofy, czyli bakterie, które uzyskują energię z utleniania prostych, jednowęglowych związków organicznych: metanu, metylu i mrówczanu.

bg‑azure

Litotrofy

Bakterie siarkowe
RRWVCxZYSQYJ91
Desulfovibrio desulfuricans redukuje siarczany powstające na skutek rozkładu (gnicia) materii organicznej, uwalniając siarkowodór – gaz o zapachu zgniłych jaj, charakterystyczny dla bagien i ścieków.
Źródło: Wikimedia Commons, domena publiczna.

Bakterie siarkowe żyją w wodach słodkich i słonych, bogatych w związki siarki – siarkowych źródłach (np. w Busku‑Zdroju), ściekach komunalnych i osadach dennych. Do chemosyntezy wykorzystują siarkowodór (np. ThiothrixSulfolobusBeggiatoa), siarkę pierwiastkową (Thiobacillus) lub tiosiarczan sodu (np. Desulfovibrio desulfuricans). W zależności od substratu uzyskują różną ilość energii w postaci ATP.

  • Thiobacillus występuje w glebie i wodzie. Utleniając siarkę, wytwarza siarczany dostępne dla roślin, przez co wprowadza pierwiastkową siarkę do obiegu w ekosystemach.

  • Trujący siarkowodór jest substratem np. dla bakterii z rodzaju Beggiatoa, które przekształcają go w nieszkodliwą siarkę, a jej nadmiar mogą magazynować w komórkach. Po ich obumarciu siarka pierwiastkowa może trafić do osadów i zostać wycofana z obiegu.

Bakterie żelazowe

Inaczej bakterie żelaziste. Pozyskują energię do procesów życiowych przez utlenianie jonu FeIndeks górny 2+ do FeIndeks górny 3+. Występują w środowiskach zakwaszonych, w których węglan żelaza(II) wykazuje większą trwałość niż w środowisku obojętnym. Produktem reakcji utleniania żelaza jest brązowy osad wodorotlenku żelaza, barwiący na rudo wodę, a w następstwie także wyposażenie łazienek, np. umywalki, wanny, muszle klozetowe.

RHuJL3Cxp9poc
Jedną z bakterii utleniających żelazo jest żyjąca w kwaśnym środowisku Leptospirillum ferrooxidans, którą ostatnio odkryto w świeżych popiołach wulkanicznych. Bakterię tę wykorzystuje się do przemysłowego biologicznego ługowania metali. Rozpuszczone w wodzie żelazo można zaobserwować w Rio Tinto w Hiszpanii.
Źródło: Wikimedia Commons, domena publiczna.
Bakterie wodorowe

Bakterie wodorowe żyją wszędzie tam, gdzie możliwe jest wykorzystanie wodoru jako dawcy, a tlenu jako akceptora elektronów, np. w glebie. Reakcja ta jest możliwa dzięki obecności enzymu hydrogenazy. Produktem reakcji utleniania wodoru jest woda.

Bakterie wodorowe można spotkać zarówno na terenach podmokłych, jak i gorących źródłach. Niektóre z nich żyją wewnątrz organizmów.

R1JGy43xNP9Ss
Jednym z gatunków bakterii wodorowych jest Helicobacter pylori, powszechnie występująca w naszych żołądkach.
Źródło: Centers for Disease Control and Prevention, Wikimedia Commons, domena publiczna.
Bakterie nitryfikacyjne

Wykorzystują w procesach metabolicznych związki azotu: od amoniaku przez azotyny do azotanów. Drobnoustroje te odgrywają ważną rolę w obiegu azotu, przekształcając lotny, szkodliwy amoniak, który powstaje podczas rozkładu szczątków i odchodów, w rozpuszczalny w wodzie jon azotanowy(V), potrzebny roślinom do produkcji np. aminokwasów. Występują w glebie i wodzie.

Reakcje utleniania amoniaku zachodzą w dwóch etapach. Najpierw bakterie z rodzaju Nitrosomonas lub Nitrosocystis utleniają go do azotanów(III). W ten sposób bakterie nitryfikacyjne poprawiają żyzność gleby czy wody.
Następnie bakterie z rodzaju Nitrobacter utleniają azotan(III) do azotanu(V). Obie grupy bakterii żyją w tym samym środowisku, gdyż Nitrobacter są zależne metabolicznie od Nitrosomonas. Dzięki utlenianiu amoniaku i produkcji azotanów przyswajalnych przez rośliny pełnią ważną rolę w obiegu azotu w przyrodzie, ale też są istotne dla rolnictwa.

Bakterie metanogenne
RTdexOgV0LQiq1
Methanobacterium palustre to bakteria typowa dla bagien i mokradeł.
Źródło: Wikimedia Commons, domena publiczna.

Jako substraty wykorzystują dwutlenek węgla i wodór, przekształcając je w metan i uwalniając przy tym energię wykorzystywaną do asymilacji dwutlenku węgla. Ta grupa bezjądrowców – archeanyarcheanyarcheany – żyje w beztlenowych środowiskach, takich jak bagna, osady rzeczne, pola ryżowe czy gnojowica. Wydobywający się z dna bagien metan może ulec samozapłonowi, dając tzw. błędne ogniki. Bakterie metanogenne żyją też w przewodach pokarmowych wielu zwierząt, m.in. przeżuwaczy – odpowiadają za powstawanie gazów jelitowych.

R1cwDJDolkFmi1
Siarkowe gorące źródło w parku Yellowstone o nazwie Chwała Poranka. Obecnie źródło zmienia barwę wody na zieloną z powodu reakcji chemicznych po wrzucaniu do niego monet „na szczęście” przez licznych turystów. Bakterie siarkowe znoszą wysoką temperaturę, dlatego często występują też przy kominach hydrotermalnych, podobnie jak bakterie żelazowe.
Źródło: Janies Child, Flickr, licencja: CC BY 2.0.
Ciekawostka

Bakterie mogą wykorzystywać jako donordonordonor elektronów nie tylko jony żelaza, ale też innych metali: arsenu, manganu, a nawet uranu! Utleniając metale, je także mogą wprowadzić do obiegu, przyczyniając się w ten sposób do krążenia materii.

Bakterie chemosyntetyzujące, które potrafią wytwarzać cukry, pełnią rolę producentów w ekosystemach niezależnych od światła, np. izolowanych jaskiniach, głębinach oceanów, ukrytych pod lodem jeziorach czy skałach. W ekosystemach tych panują skrajne warunki temperatury, ciśnienia czy zakwaszenia, jednak bakterie potrafiły się do nich przystosować. Bez ich działania niemożliwe byłoby przywrócenie obiegu materii pomiędzy elementami biosfery.

Ciekawostka

W 1 kg żyznej ziemi znajduje się kilka miliardów różnych drobnoustrojów. Obliczono, że bakterie z 1 ha gleby mogą ważyć od 3 do 20 ton. Najliczniej występują one w górnej warstwie gleby i przy korzeniach roślin.

RH28H1odCamw2
Bakterie glebowe to prawdziwi bohaterowie – mogą pomóc roślinom znosić wahania temperatury, zakwaszenie gleby i wchłaniać sole mineralne. Występują we wszystkich glebach: od żyznych próchniczych do podmokłych i zabagnionych – w tych ostatnich dobrze się czują np. bakterie metanogenne.
Źródło: U.S. Department of Agriculture, Flickr, domena publiczna.
bg‑azure

Bakterie jako destruenci

Bakterie odgrywają ważną rolę w procesach wykorzystania pierwiastków do produkcji materii organicznej (fotosynteza, chemosynteza), która trafia do konsumentów. Konsumenci wykorzystują tę materię do budowy własnych organizmów i przeprowadzania procesów życiowych. Szczątki organiczne, np. opadłe liście, martwe organizmy czy odchody, trafiają do gleby, gdzie ich rozkładem zajmują się destruenci (reducenci) – głównie bakterie i grzyby. Ponieważ białka, kwasy nukleinowe, a także mocznik i kwas moczowy zawierają związki azotu, istotną rolę w obiegu tego pierwiastka pełnią bakterie amonifikacyjne. Należą do nich różni przedstawiciele rodzajów: Clostridium, Proteus, PseudomonasStreptomyces. W procesie amonifikacji ze związków organicznych powstaje amoniak, który rozpuszcza się w wodzie – w ten sposób powstają przyswajalne dla roślin jony amonowe i obieg azotu się zamyka.

Inne bakterie, głównie laseczki Bacillus, odpowiadają za gnicie szczątków organicznych. Procesy gnilne zachodzą w warunkach beztlenowych, a produktem rozkładu białek są związki dostępne dla roślin oraz m.in. siarkowodór, wykorzystywany przez chemotrofychemotrofychemotrofy. W ten sposób do obiegu wraca np. siarka. Bakterie glebowe Actinobacteria (promieniowce) także biorą udział w rozkładzie materii organicznej, głównie polisacharydów (jak celuloza, chityna) i tłuszczów.

Słownik

archeany
archeany

jednokomórkowe, bezjądrowe organizmy żyjące w ekstremalnych warunkach; razem z eubakteriami zaliczane do prokariontów

chemosymbiotyczne organizmy (chemosymbionty)
chemosymbiotyczne organizmy (chemosymbionty)

zwierzęta, w których tkankach żyją bakterie chemosyntetyzujące; dostarczają bakteriom siarkowodór, w zamian otrzymując związki organiczne; np. rurkoczułkowce

chemotrofy
chemotrofy

organizmy, które jako źródło energii wykorzystują reakcje utleniania związków chemicznych

donor
donor

dawca; związek chemiczny oddający wolny elektron w przebiegu reakcji utleniania

komin hydrotermalny
komin hydrotermalny

szczelina na dnie basenu oceanicznego, spotykana najczęściej w miejscach aktywnych wulkanicznie i w rejonach rozsuwania się płyt tektonicznych, przez którą wydostaje się ciepła (geotermalna) woda

koniugacja
koniugacja

proces wymiany części materiału genetycznego między osobnikami tego samego pokolenia (poziomo); podczas koniugacji zachodzi zwiększanie różnorodności genetycznej, nie zwiększa się jednak liczba organizmów – nie jest to więc rozmnażanie; koniugacja występuje u bakterii i niektórych protistów

ługowanie metali
ługowanie metali

biochemiczne upłynnianie nierozpuszczalnych związków metali przy pomocy drobnoustrojów; jest wynikiem wielu reakcji enzymatycznych i chemicznych

metabolizm
metabolizm

ogół przemian chemicznych w komórce; składa się z reakcji syntezy (anabolizm) i rozpadu (katabolizm)

proteobakterie
proteobakterie

duża grupa bakterii charakteryzująca się występowaniem RNA jako materiału genetycznego; mają otoczkę komórkową zbudowaną z lipopolisacharydów

rurkoczułkowce
rurkoczułkowce

osiadłe, morskie pierścienice; jedna ich grupa (zatyczkowce) nie ma przewodu pokarmowego i odżywia się dzięki symbiozie z bakteriami utleniającymi siarkowodór (chemosyntetyzującymi)

zimny wyciek
zimny wyciek

inaczej zimny otwór wentylacyjny; płytki obszar w dnie oceanu, gdzie występuje wyciek płynu bogatego w węglowodory (przede wszystkim w metan i siarkowodór); określenie zimny jest używane ze względu na to, że wyciek ma niższą temperaturę od bardzo ciepłych otworów hydrotermalnych