Skrypt „Metodyka realizacji innowacyjnego programu dydaktycznego w szkołach ponadgimnazjalnych”, zawiera min. metodologię korzystania z zasobów przygotowanych w ramach projektu wraz z przykładowymi scenariuszami zajęć dydaktycznych. Skrypt zawiera opis metodologii holistycznego prowadzenia zajęć, umożliwiającej nauczycielom wiązanie treści trzech przedmiotów ścisłych – matematyki, fizyki, chemii oraz nauczanie praktyczne, pokazując uczniom eksperymenty w szkole lub eksperymenty dostępne jako materiały filmowe lub w Internecie. W scenariuszach lekcji wykorzystano wykłady nagrane podczas trwania projektu, dostępne drogą internetową dla wszystkich szkół.