1
Pokaż ćwiczenia:
Rs5s1dbj9tft11
Ćwiczenie 1
Poniżej przedstawiono 4 sekwencje mRNA. Pierwsza sekwencja to mRNA bez mutacji. Kolejne 3 to mRNA będące efektem mutacji. Wskaż sekwencję odpowiadającą mRNA będące efektem mutacji zmiany fazy odczytu. Możliwe odpowiedzi: 1. AUGGCCTGCAAACGCTGG, 2. AUGGCCTGAAAACGCTGG, 3. AUGGCCCTGAAAACGCTGG, 4. AUGGCCGGCAAACGCTGG
Rs5ESFYw1UfYN1
Ćwiczenie 2
Łączenie par. Oceń, czy podane stwierdzenia są prawdziwe czy fałszywe.. Mutacje zmiany ramki odczytu są zawsze mutacjami punktowymi.. Możliwe odpowiedzi: Prawda, Fałsz. Delecje nukleotydów wiążą się zawsze z przesunięciem ramki odczytu.. Możliwe odpowiedzi: Prawda, Fałsz. Możliwe jest przesunięcie ramki odczytu w wyniku substytucji jednego lub dwóch nukleotydów danego genu.. Możliwe odpowiedzi: Prawda, Fałsz. Zmiana ramki odczytu może skutkować zarówno wydłużeniem, jak i skróceniem powstającego w translacji peptydu.. Możliwe odpowiedzi: Prawda, Fałsz
2
Ćwiczenie 3

W 2020 r. w prestiżowym czasopiśmie „**Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America” opublikowano wyniki badań nad supresją (blokowaniem) efektów mutacji przesunięcia ramki odczytu u bakterii Escherichia coli. Mutacja dotyczyła kluczowego dla życia bakterii genu rpoB, kodującego jedną z podjednostek polimerazy RNA (niezbędnej do transkrypcji). Wstawienie jednego nukleotydu skutkuje zmianą dziewięciu aminokwasów i wcześniejszą terminacją translacji wspomnianej podjednostki polimerazy RNA. U bakterii opornych na rifampicynę (rodzaj antybiotyku) odkryto mechanizm częściowego zahamowania efektów opisanej mutacji. Rybosom „pomija” podczas translacji jeden z nukleotydów, co zmienia ramkę odczytu w sposób zapewniający normalną długość i funkcjonalność polimerazy RNA. W stosunku do enzymu typu dzikiego polimeraza RNA po supresji mutacji różni się jedynie trzema aminokwasami.

Indeks górny Na podstawie: Douglas L. Huseby i in., Antibiotic resistance by high‑level intrinsic suppression of a frameshift mutation in an essential gene, „PNAS” 2020, nr 117(6), s. 3185–3191. Indeks górny koniec

R1WJRDcU80ZyR
Na podstawie powyższego tekstu i własnej wiedzy uzupełnij poniższy tekst tak, żeby stanowił poprawną całość. W tym celu wybierz odpowiednie określenia. Zmiana sekwencji aminokwasów w jednej z podjednostek polimerazy RNA bakterii opornych na rifampicynę wpływanie wpływa na rodzaj katalizowanej przez nie reakcji. U szczepów opornych dochodzi do dwóch zmian fazy odczytu spowodowanych wyłącznienie tylko przez zmianę składu nukleotydowego genu. Spowodowana pierwszą zmianą fazy odczytu wcześniejsza terminacja translacji skutkuje {#mutacjami zmiany sensu}mutacjami milczącymi. Supresja efektów pierwszej fazy odczytu wynika w głównej mierze z cofnięcia mutacji nonsensownejzmiany sensu, dzięki czemu docelowe białko nie jest krótsze od białka typu dzikiego.
2
Ćwiczenie 4

Aminokwasy zasadowe to takie, które wykazują odczyn zasadowy ze względu na obecność większej liczby grup -NHIndeks dolny 2 niż -COOH. Do grupy tej zaliczamy lizynę, argininę i histydynę. 
Dana jest następująca sekwencja nici kodującej DNA: 5′ ATGCCAAGCGGA 3′. Pomiędzy pierwszym a drugim nukleotydem trzeciego kodonu nici matrycowej tego DNA dokonano wstawienia jednego nukleotydu guaninowego (I) lub dwóch nukleotydów guaninowych (II).

RIBHeqqRCL970
Przyporządkuj odpowiednie sekwencje nukleotydów do wymienionych matrycowych nici DNA (pamiętaj, że sekwencje podawane są od końca 5’ do końca 3’). Nić matrycowa DNA przed mutacją Możliwe odpowiedzi: 1. TCCGCTTGGGCAT, 2. TCCGCTTGGGGCAT, 3. TCCGCTTGGCAT Nić matrycowa DNA po mutacji I Możliwe odpowiedzi: 1. TCCGCTTGGGCAT, 2. TCCGCTTGGGGCAT, 3. TCCGCTTGGCAT Nić matrycowa DNA po mutacji II Możliwe odpowiedzi: 1. TCCGCTTGGGCAT, 2. TCCGCTTGGGGCAT, 3. TCCGCTTGGCAT
R11rozhzSVv8s2
Ćwiczenie 5
Która z opisanych w tekście do zadania 4. mutacji spowoduje zmianę drugiego aminokwasu w peptydzie, który powstanie w wyniku translacji danego mRNA? Możliwe odpowiedzi: 1. I, 2. II, 3. Obie, 4. Żadna
RpyPu98qkD5Kx2
Ćwiczenie 6
Zaznacz nazwy dwóch typów mutacji dotyczących drugiego kodonu mRNA powstałego wskutek mutacji I (opisanej w tekście do zadania 4): Możliwe odpowiedzi: 1. Mutacja zmiany sensu, 2. Mutacja milcząca, 3. Insercja, 4. Delecja, 5. Substytucja
31
Ćwiczenie 7
RtlfxdzTx7bh0
Na podstawie tekstu do zadania 4., tabeli kodu genetycznego i własnej wiedzy, oceń która z mutacji (I czy II) spowoduje powstanie (w wyniku późniejszej translacji) peptydu o charakterze silniej zasadowym. W odpowiedzi uwzględnij zarówno sekwencje mRNA po każdej z mutacji, jak i sekwencje aminokwasów w każdym z peptydów powstałych na matrycy zmutowanych mRNA. (Uzupełnij).
31
Ćwiczenie 8

Pewien zespół badawczy zsyntetyzował pojedynczą nić RNA o sekwencji 5′ AUGGCGUUACGUUGAGGGAAA… 3′, a następnie wprowadził zmianę polegającą na delecji nukleotydów od 8 do 10. Naukowcy stwierdzili, że delecja ta (w przypadku zajścia translacji) nie spowoduje zmiany jakiegokolwiek aminokwasu peptydu na inny, a jedynie skrócenie peptydu o jeden aminokwas.

R83Xdaksw9MLX
Na podstawie powyższego tekstu, tabeli kodu genetycznego i własnej wiedzy oceń czy stwierdzenie naukowców było prawdziwe. Swoją odpowiedź uzasadnij odnosząc się zarówno do zamiany składu, jak i długości peptydu mogącego powstać z mRNA po mutacji. (Uzupełnij).