W symulacji porównano tworzenie cząsteczki D N A w wyniku replikacji oraz syntezy de novo. Tworzenie D N A wskutek replikacji. Pokazano dołączanie do już istniejącej, pojedynczej nici kolejnych nukleotydów z komplementarnymi zasadami od końca pięć prim do trzy prim. Do ostatniego nukleotydu dwuniciowego fragmentu transportowany jest trójfosforan nukleozydu. Wiązanie zostaje utworzone pomiędzy resztą fosforanową nukleotydu, od której odłączana jest grupa zawierająca dwa atomy fosforu. Z kolei pomiędzy komplementarnymi zasadami nowo przyłączonego nukleotydu i nukleotydu z pierwotnie pojedynczej nici zostają utworzone wiązania wodorowe. Pomiędzy parą adenina tymina występują dwa wiązania wodorowe. Zaś pomiędzy cytozyną i guaniną - trzy. Obszar, łańcucha zawierający fragment jedno- jak i dwuniciowy jest zakreślony przerywaną linią. Wskazuje on na miejsce działania polimerazy D N A, enzymu odpowiedzialnego za syntezę dwuniciowego łańcucha na drodze dołączania kolejnych nukleotydów do istniejącej już pojedynczej nici kwasu nukleinowego. Poniżej znajduje się informacja. Synteza D N A w komórka przebiega na skutek replikacji. Jest to proces przeprowadzany przez enzym polimerazę D N A zależną od D N A i zachodzi na matrycy już istniejącej cząsteczki D N A. Nowa nić jest syntezowana w kierunku pięć prim trzy prim. Tworzenie D N A de novo. Pokazano tworzenie pojedynczej nici od końca trzy prim do końca pięć prim. Kolejne nukleotydy zawierające grupy ochronne, w tym przypadku D M T r, zostają dołączone do łańcucha, z którego usuwana jest uprzednio grupa ochronna. D M T r to grupa cztery, cztery prim dimetoksytrytylowa. Kolejność zasad w łańcuchu jest następująca guanina, tymina, cytozyna, adenina, guanina, tymina, cytozyna, adenina, guanina, tymina, cytozyna, adenina. Poniżej przedstawiono informację. Synteza de novo nie zachodzi w komórkach. Jest to technika wykorzystywana w laboratoriach do tworzenia cząsteczek D N A o ustalonej sekwencji. Substratami do reakcji są zmodyfikowane nukleotydy zawierająca grupy ochronne (na przykład D M T r), po których usunięciu możiiwe jest przyłączenie w odpowiednim miejscu kolejnego nukleotydu. Produktem syntezy D N A de nowo jest jednoniciowa cząsteczka.