bg‑cyan

Zmienność genetyczna

Zmienność genetyczna polega na występowaniu naturalnych różnic w genotypie organizmów należących do tego samego gatunku. Może być to zmienność rekombinacyjna lub mutacyjna.

bg‑cyan

Zmienność rekombinacyjna

Zmienność rekombinacyjna polega na istnieniu różnych kombinacji alleliallelalleli w puli genetycznej. Oznacza to, że każdy przedstawiciel danego gatunku ma inny zestaw alleli, a tym samym odmienną informację genetyczną. Do zmian w kombinacjach alleli dochodzi w trakcie podziałów komórkowych.

Dzięki rekombinacji genetycznej, podczas której dochodzi do wymiany materiału genetycznego, powstają nowe genotypygenotypgenotypy. Wyróżnia się kilka źródeł zmienności genetycznej:

  • niezależna segregacja genów – niezależna segregacja chromosomów (allele różnych genów są rozdzielane do gamet niezależnie od siebie);

  • zjawisko crossing‑over;

  • losowe łączenie się gamet podczas zapłodnienia;

  • alternatywny splicing;

  • rekombinacja nieuprawniona (niehomologiczna) – transpozony.

Rekombinacja jest też metodą usuwania uszkodzeń nici DNA.

Wymiana fragmentów między chromosomami homologicznymi podczas crossing‑over

Crossing‑overcrossing‑overCrossing‑over zachodzi w profazie I mejozy, gdy chromosomy homologiczne tworzą biwalenty. Proces ten powoduje rozdzielenie sprzężonych genów, czyli genów leżących na tych samych chromosomach, i powstanie nowych sprzężeń.

Chromosomy homologiczne tworzą połączenia nazywane chiazmami, które następnie ulegają rozerwaniu, a oderwane fragmenty łączą się z sąsiednimi chromatydami. Rezultatem tego jest „przetasowanie” genów pochodzenia matczynego i ojcowskiego, prowadzące do powstania nowych, przypadkowych kombinacji genów.

Im dalej od siebie położone są dwa geny w chromosomie, tym słabsze jest sprzężenie między nimi, a crossing‑over zachodzi częściej. Geny leżące bardzo blisko siebie są zazwyczaj przekazywane z pokolenia na pokolenie. W związku z tym częstość crossing‑over pomiędzy dwoma genami zależy od odległości między nimi.

Zależność ta umożliwia określenie położenia genu na chromosomie, czyli dokonanie tzw. mapowania genów, ponieważ odległość między genami wyraża się w procentach osobników zrekombinowanych. Przyjęto, że odległość odpowiadająca prawdopodobieństwu rekombinacji wynoszącemu 1% stanowi 1 jednostkę mapową (1 morgan).

RDsrgUoSbo8bi
Schemat przedstawia przykład pojedynczego crossing‑over. Kolorem niebieskim i zielonym zaznaczono chromosomy homologiczne. Tworzą one biwalent. Sąsiadujące chromatydy łączą się ze sobą (chiazma). Następnie połączenie to ulega rozerwaniu i dochodzi do wymiany odcinków. W ten sposób powstaje para chromosomów zrekombinowanych (są dwukolorowe) oraz para chromosomów niezrekombinowanych (mają jednolity kolor).
Źródło: Masur, Wikimedia Commons, domena publiczna.
Niezależna segregacja chromosomów

Losowe rozchodzenie się chromosomów zachodzi w anafazie I mejozy. Allele dwóch (lub więcej) różnych genów są rozdzielane do gamet niezależnie od siebie.

RzmWAGf6Ti9eS
Losowa segregacja chromosomów może prowadzić do różnych układów genetycznych.
Źródło: pl.khanacademy.org, licencja: CC BY 3.0.
Losowe łączenie się gamet podczas zapłodnienia

Powstałe w procesie mejozy gamety łączą się losowo, dzięki czemu potomstwo uzyskuje nowe kombinacje genów.

Różne kombinacje eksonów podczas alternatywnego splicingu

Alternatywny splicingsplicingsplicing dotyczy genów, które mają charakter nieciągły – czyli składających się z intronówintronintronów i eksonóweksoneksonów. Proces ten zachodzi tylko w jądrach komórek eukariotycznych. Z pierwotnego transkryptu wycinane są zawsze wszystkie introny, ale w alternatywnym splicingu usunięte mogą zostać również niektóre eksony. Powstaje w ten sposób mRNA zawierający różne fragmenty transkrybowanej nici matrycowej DNA.

RdKHtUgzsLjnG1
W wyniku alternatywnego splicingu z jednego genu może powstać wiele różnych cząsteczek mRNA. Kolorem jasnoniebieskim zostały zaznaczone introny, natomiast różnokolorowe ponumerowane odcinki to eksony.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
Rekombinacja nieuprawniona – transpozony

TranspozonytranspozonyTranspozony to tzw. ruchome elementy genetyczne, zdolne do przemieszczania się po całym genomiegenomgenomie organizmu. Proces przemieszczania się transpozonów, nazywany transpozycjątranspozycjatranspozycją, jest typem rekombinacji nieuprawnionej, która nie wymaga homologii sekwencji nukleotydowych cząsteczek DNA. Transpozycja sterowana jest przez specyficzne enzymy – transpozazy, kodowane przez transpozony. Elementy te mogą wywoływać duże zmiany w strukturze genomu, takie jak inwersje, delecje oraz duplikacje dużych fragmentów DNA. Gen, w którym doszło do insercji transpozonu, zwykle ulega inaktywacji, natomiast geny znajdujące się między dwiema kopiami transpozonu mogą ulec delecji po uruchomieniu transpozycji.

Transpozycja DNA jest powszechnie spotykana w ludzkim genomie, najczęściej jednak nie obejmuje sekwencji kodujących. U kręgowców transpozony mogą stanowić nawet 40% genomowego DNA.

Więcej informacji na temat zmienności mutacyjnej znajdziesz w e‑materiałach pt.: Zmienność genetyczna motorem przemian ewolucyjnych, Mejoza – źródło zmienności genetycznejTranspozony – ruchome elementy genetyczne.

bg‑cyan

Zmienność mutacyjna

Za zmienność genetyczną odpowiadają również mutacjemutacjamutacje DNA. Mutacje to nagłe, skokowe zmiany w materiale genetycznym komórki. Są dziedziczone przez potomstwo, gdy dotyczą materiału genetycznego komórek rozrodczych (komórek jajowych i plemników). Mutacje zachodzące w innych komórkach (np. nowotworowych) – tzw. mutacje somatyczne – są nabyte i niedziedziczne.

Ze względu na obszar zmian, jakie są wywoływane w DNA, mutacje dzieli się na genowechromosomowe.

bg‑gray3

Mutacje genowe

Mutacje genowe zachodzą w obrębie jednego genu i dotyczą zmiany sekwencji nukleotydów. Do mutacji tego typu należy substytucja, w której dochodzi do zastąpienia jednej zasady azotowej inną. Może mieć ona charakter tranzycji (zastąpienie puryny puryną i pirymidyny pirymidyną) lub transwersji (zastąpienie puryny pirymidyną bądź pirymidyny puryną). Mutacją punktową jest także delecja, w której przypadku dochodzi do usunięcia jednej lub kilku par nukleotydów, co prowadzi do skrócenia genu. Ostatnim rodzajem mutacji punktowych jest insercja, polegająca na wstawieniu dodatkowych nukleotydów do DNA.

RbBNdxTt67Gvr1
Ilustracja interaktywna przedstawia rodzaje mutacji genowych i ich skutki. Na początku przedstawiono sekwencję przed mutacją. Na ilustracji jest nić matrycowa DNA - ma postać poziomej linii, pod którą są litery w następującej kolejności od lewej do prawej strony: C A A A G A A C C G T A, poniżej jest kolejna pozioma linia - to nić mRNA, nad którą są litery w następującej kolejności: G U U U C U U G G S A U. Pod sekwencją G U U jest Val, pod U C U Ser, pod U G G Trp, pod C A U His - to kolejność aminokwasów w białku. Od „sekwencji przed mutacją” są trzy strzałki: jedna prowadzi do delecji, druga do insercji, trzecia do substytucji. Delecja. Dochodzi do usunięcia nukleotydu A w nici matrycowej DNA. Mutacja ta powoduje przesunięcie ramki odczytu. Na ilustracji są ponownie dwie nici - DNA i równoległa do niej mRNA. Z sekwencji nukleotydów na początku łańcucha: C A A A usunięto ostatnie A. Następnie jest G A A C C G T A. W nici mRNA pod nukleotydami zaznaczono: G U U to Val, C U U to Leu, G C C to Gly, na końcu łańcucha jest A U. W przypadku insercji dochodzi do dodania nukleotydu T w nici matrycowej DNA. Mutacja ta powoduje przesunięcie ramki odczytu. Ponownie na ilustracji jest nić DNA i równoległa do niej mRNA. W nici DNA dodano T na początku sekwencji nukleotydów, czyli zapis wygląda następująco: C A A T (na czerwono) A G A A C C G T A. W nici mRNA kolejność aminokwasów w białku jest następująca: G U U to Val, A (na czerwono) U C to Ile, U U G to Leu, G C A to Ala, na końcu pozostaje U. Substytucja. Od substytucji prowadzą trzy rozgałęzienia. Na pierwszej ilustracji przedstawiono zamianę nukleotydu A na nukleotyd G. Mutacja ta powoduje zmianę jednego aminokwasu w sekwencji. Na ilustracji jest nić DNA oraz równoległa do niej nić mRNA. W sekwencji nukleotydów na początku nici DNA nastąpiła zamiana - zamiast C A A A G jest C G (na czerwono) A A G. To mutacja zmiany sensu. W nici mRNA jest następująca kolejność aminokwasów w białku: G C (na czerwono) U to Ala, U C U to Ser, U G G to Trp, C A U to his. Na następnej ilustracji przedstawiono mutację synonimiczną. Dochodzi w niej do zamiany nukleotydu A na nukleotyd G. Mutacja ta nie powoduje zmian w sekwencji aminokwasów. Na ilustracji jest nić DNA i równoległa do niej nić mRNA. W nici DNA zamiast kolejności na początku C A A A G jest C A G (na czerwono) A G. W mRNA kolejność aminokwasów w białku jest następująca: G U C (na czerwono) to Val, U C U to Ser, U G G to Trp, C A U to His. Kolejny przykład substytucji to mutacja nonsensowna. Dochodzi do zamiany nukleotydu C na nukleotyd T. Do sekwencji aminokwasów zostaje włączony kodon STOP, co oznacza koniec translacji. Na ilustracji jest nić DNA i równoległa do niej nić mRNA. W nici DNA pod koniec zamieniono sekwencję C G T A na T (na czerwono) G T A. Kolejność aminokwasów w białku w nici mRNA: G U U to Val, U C U to Ser, U G A (na czerwono) to kodon STOP, następnie jest sekwencja C A U.
Rodzaje mutacji genowych i ich skutki.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY 3.0.
Jakie skutki wywołują mutacje genowe?
R1V2HccqHRyhV1
Wymyśl pytanie na kartkówkę związane z tematem materiału.
bg‑gray3

Mutacje chromosomowe

Mutacje chromosomowe mogą dotyczyć pojedynczych chromosomów lub całego garnituru chromosomalnego organizmów.

Aberracje strukturalne

Aberracje strukturalne to mutacje chromosomowe będące zmianami w budowie pojedynczych chromosomów. Fragment chromosomu może zostać powielony (duplikacja), co wiąże się z powstaniem dodatkowych kopii fragmentu informacji genetycznej. Może też zostać usunięty (delecja, zwana także czasami deficjencją), co prowadzi do utraty fragmentu, całości lub nawet kilku genów. Natomiast odwrócenie fragmentu chromosomu o 180° (inwersja) wiąże się ze zmianą kolejności wszystkich nukleotydów w części zmienionej chromosomu. Ponadto fragment chromosomu może zostać przemieszczony do innego chromosomu, niekoniecznie tej samej pary (translokacja). Ten rodzaj mutacji może być niekorzystny dla organizmu, ale w niektórych przypadkach wywołuje korzystny efekt fizjologiczny.

RtiC1h3GXTRly1
Rodzaje mutacji chromosomowych strukturalnych.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., Wikimedia Commons, licencja: CC BY-SA 3.0.
Liczbowe mutacje chromosomowe

Kolejny rodzaj mutacji chromosomowych dotyczy zmiany ich liczby. Liczbowe mutacje chromosomowe to największe zmiany materiału genetycznego. Są one wynikiem zaburzeń podczas mejotycznych podziałów komórkowych. Polegają na utracie lub występowaniu dodatkowych pojedynczych chromosomów na skutek zaburzeń rozdziału chromosomów podczas mitozy lub mejozy. Dochodzi również do zwielokrotnienia całego genomu z powodu zniesienia rozdziału wszystkich chromosomów (poliploidalność).

  • Poliploidie

Poliploidie to mutacje, w których dochodzi do zwielokrotnienia całego genomu organizmu. Powstałe mutanty określane są jako 3n (triploid), 4n (tetraploid) itd. Powodem takich zmian jest nierozdzielenie chromosomów lub wielokrotna replikacja DNAreplikacja DNAreplikacja DNA podczas endomitozendomitozaendomitoz niezakończonych podziałem komórki. W świecie zwierzęcym poliploidyzacja jest zazwyczaj mutacją śmiertelną (letalną), natomiast u roślin – z punktu widzenia człowieka – jest pożądana, gdyż pozwala uzyskać większą bujność: większe liście, więcej ziaren w kłosie, dłuższe i silniejsze pędy itp.

Prawie 80% gatunków roślin to poliploidy, z czego większość to alloploidyalloploid, allopoliploidalloploidy. Allopoliploidalność pozwala na bardzo szybką specjację: wystarczy jedno pokolenie, by utworzył się nowy, izolowany rozrodczo gatunek. Istnienie tego zjawiska może wyjaśniać nagłe pojawienie się wielu gatunków roślin kwiatowych w zapisie kopalnym oraz ich obecną wielką różnorodność (235 tys. gatunków).

R13sX9EOOTcEC
Pierwiosnek z Kew (Primula kewensis).

Przykładem poliploidalności, udokumentowanym w Królewskich Ogrodach Botanicznych w Kew w Londynie (Anglia), jest tzw. pierwiosnek z Kew (Primula kewensis). Ten mieszaniec dwóch gatunków pierwiosnków – Primula floribunda (2n = 18) oraz Primula verticillata (2n = 18) – miał liczbę chromosomów równą 18, ale był niepłodny. Później stwierdzono trzy niezależne przypadki samorzutnego powstania płodnych linii, które były allopoliploidalne (2n = 36) i wydały żywotne nasiona.
Źródło: Vincent Brassinne, Flickr, licencja: CC BY-NC-ND 2.0.
R18Ehy9B9tre2
Poziewnik szorstki (Galeopsis tetrahit).

Przykładem poliploidalności jest poziewnik szorstki (Galeopsis tetrahit; 2n = 32), występujący na obszarach klimatu umiarkowanego w Europie i Azji. Przypuszczalnie powstał on w wyniku hybrydyzacji dwóch gatunków: poziewnika miękkowłosego (Galeopsis pubescens; 2n = 16) i poziewnika pstrego (Galeopsis speciosa; 2n = 16).
Źródło: Hajotthu, Wikimedia Commons.

Jeśli w środowisku pojawi się populacja allopoliploidów (tzn. nowego gatunku), presja selekcyjna doprowadzi do jednej z trzech możliwości. Po pierwsze nowy gatunek może ulec konkurencji macierzystych gatunków i wymrzeć. Po drugie osobniki allopoliploidalne mogą zająć nieco inną niszę ekologicznąnisza ekologicznaniszę ekologiczną, dzięki czemu będą współistnieć z gatunkami rodzicielskimi. Po trzecie gatunek mieszańcowy może skutecznie konkurować z jednym lub obydwoma gatunkami rodzicielskimi i wyprzeć je z części lub całego obszaru ich występowania.

R1QGRgGqRt6ys
Triticum aestivum – heksaploidalna pszenica wykorzystywana do produkcji chleba.
Źródło: David Monniaux, Wikimedia Commons, licencja: CC BY-SA 3.0.
  • Aneuploidie

Aneuploidie są mutacjami zmieniającymi liczbę chromosomów w parach chromosomów homologicznych.

  • Hipoaneuploidie

Hipoaneuploidie doprowadzają do powstania monosomika – organizmu z brakującym chromosomem z pary homologicznej (2n − 1).

  • Hiperaneuploidie

W przypadku hiperaneuploidii powstały organizm – trisomik – zawiera dodatkowy chromosom z pary (2n + 1). Zmniejszenie, jak i zwielokrotnienie liczby może dotyczyć także chromosomów kilku par homologicznych. Obecność dwóch dodatkowych chromosomów różnych par homologicznych daje podwójnego trisomika (2n + 1 + 1). Dodatkowa para chromosomów homologicznych powoduje powstanie tetrasomika (2n + 2). Brak dwóch chromosomów niebędących homologicznymi powoduje powstanie podwójnego monosomika (2n − 1 − 1). Brak pary chromosomów homologicznych daje nullisomika (2n − 2).

Słownik

allel
allel

(gr. allos – inny) forma genu; jedna z wersji genu różniąca się od pozostałych sekwencją nukleotydów; zajmuje określone miejsce na chromosomie

alloploid, allopoliploid
alloploid, allopoliploid

(z gr. állos – inny, plóos –zwijanie) organizm (głównie roślinny) zawierający w jądrach komórek somatycznych więcej niż dwa niehomologiczne, diploidalne zespoły chromosomów; powstały poprzez skrzyżowanie dwóch, pochodzących od różnych gatunków gamet rodzicielskich, w których nie doszło do podziału redukcyjnego (mejozy)

crossing‑over
crossing‑over

(z ang. crossing – skrzyżowanie) wymiana podczas mejozy (profaza I, pachyten) odcinków między chromosomami homologicznymi tworzącymi biwalent chromosomalny

ekson
ekson

odcinek genu kodujący sekwencję aminokwasów w polipeptydzie lub sekwencję nukleotydów w RNA

endomitoza
endomitoza

(z łac. éndon – wewnątrz, mítos – nić) podział chromosomów, w którym nie występuje podział jądra i komórek

genom
genom

kompletny zestaw informacji genetycznej danego organizmu

genotyp
genotyp

zespół wszystkich genów obecnych w danym organizmie i kształtujących jego fenotyp

intron
intron

odcinek genu niekodujący sekwencji aminokwasów w polipeptydzie; rozdziela eksony w genach komórek eukariotycznych

mutacja
mutacja

(z łac. mutatio – zmiana) nagła zmiana informacji genetycznej organizmu; jest dziedziczna, jeżeli zachodzi w materiale genetycznym komórek rozrodczych

nisza ekologiczna
nisza ekologiczna

związek populacji ze środowiskiem; oznacza zajmowaną przez gatunek przestrzeń fizyczną wraz z oddziałującymi na nią czynnikami fizykochemicznymi środowiska

replikacja DNA
replikacja DNA

proces powielania DNA, w wyniku którego z jednej cząsteczki DNA powstają dwie identyczne kopie

splicing
splicing

(z ang. splice – łączenie) proces tworzenia mRNA; sklejanie eksonów komórek eukariotycznych po wycięciu intronów

transpozony
transpozony

sekwencja DNA, która może przemieszczać się na inną pozycję w genomie tej samej komórki w wyniku procesu zwanego transpozycją

transpozycja
transpozycja

(z łac. transponere - przestawiać) proces przemieszczania się transpozonu na inną pozycję w genomie tej samej komórki