Przeczytaj
Czym jest ekspresja genów?
Budowa i właściwości białek są determinowane przez kolejność aminokwasów w budujących je łańcuchach polipeptydowych. Każde białko ma unikalną sekwencję aminokwasów, o której decyduje informacja genetyczna zawarta w DNA (kwasie deoksyrybonukleinowym).
Ekspresja genu kodującego białko to proces prowadzący do wytworzenia cząsteczek białka. Przebiega w dwóch głównych etapach:
transkrypcji;
translacji.
Proces ekspresji genu:
prowadzi m.in. do syntezy białek enzymatycznych oraz hormonów białkowych, które kierują procesami przemiany materii u organizmów;
jest jednym z głównych procesów wymagających dostarczenia energii (proces anaboliczny);
u organizmów wielokomórkowych rodzaj oraz liczba cząsteczek białek, jak i szybkość ich biosyntezy są bardzo precyzyjnie regulowane.
Ekspresja genu u organizmów prokariotycznych
U prokariontów zarówno transkrypcja, jak i translacja zachodzą w cytozolu komórki (nie są rozdzielone przestrzennie).
Geny bakteryjne są zorganizowane w operonyoperony, co sprawia, że mRNAmRNA zawiera informacje o budowie wielu białek, najczęściej należących do jednego szlaku metabolicznego.
Ponieważ geny organizmów prokariotycznych nie zawierają odcinków niekodujących (intronów), nie występuje u nich proces splicingusplicingu. Prokariotyczne mRNA nie podlega także żadnym innym procesom obróbki potranskrypcyjnej. Dzięki temu powstający w wyniku transkrypcji mRNA może zostać natychmiast wykorzystany przez rybosomy w procesie translacji. Rybosomy organizmów prokariotycznych rozpoczynają zwykle translację nici mRNA, która jeszcze nie została do końca zsyntetyzowana, czyli podczas trwającego jeszcze procesu transkrypcji. Procesy transkrypcji i translacji nie są więc rozdzielone czasowo.
Wiele rybosomów związanych z jedną cząsteczką mRNA tworzy strukturę określaną jako polirybosom.
Rybosomy prokariotyczne mają stałą sedymentacjistałą sedymentacji 70S i składają się z dwóch podjednostek: dużej (50S) i małej (30S). Translacja rozpoczyna się od przyłączenia do końca 5′ transkryptu małej podjednostki rybosomu, do której następnie przyłącza się duża podjednostka. W wyniku przesuwania się mRNA względem rybosomu odczytywane są kolejne kodony i na ich podstawie przyłączane są kolejne aminokwasy, co powoduje wydłużanie łańcucha polipeptydowego. Po zakończeniu translacji następuje rozłączenie podjednostek rybosomu, mRNA i białka.
Ekspresja genu u organizmów eukariotycznych
U eukariontów proces transkrypcji zachodzi w jądrze komórkowym, natomiast proces translacji – w cytozolu.
Powstałe w wyniku transkrypcji cząsteczki RNA są nazywane pierwotnym transkryptem lub pre‑mRNApre‑mRNA. Pre‑mRNA jest poddawany obróbce potranskrypcyjnej (zachodzącej głównie w jądrze komórkowym), zwanej procesem dojrzewania. Obejmuje ona przyłączanie czapeczki na końcu 5′ i ogona poli(A) na końcu 3′, które zabezpieczają transkrypt przed degradacją, oraz splicing, w którym fragmenty niekodujące zostają usunięte. Dopiero dojrzałe cząsteczki mRNA mogą się przemieszczać z jądra do cytozolu i uczestniczyć w przebiegu translacji, gdzie mRNA jest używany przez rybosomy jako matryca. mRNA eukariotyczne zawsze zawiera informacje o budowie tylko jednego peptydu. Proces translacji w komórkach eukariotycznych przebiega tak samo jak u prokariontów, jednak przeprowadzają go rybosomy typu 80S, złożone z podjednostek 60S i 40S. Powstały w wyniku translacji łańcuch polipeptydowy przechodzi następnie proces fałdowania, podczas którego przyjmuje strukturę przestrzenną. Powstałe w ten sposób białko może podlegać obróbce potranslacyjnej.
W komórkach eukariotycznych materiał genetyczny znajduje się nie tylko w jądrze. Mitochondria i obecne w komórkach roślinnych plastydy zawierają własne DNA, które również podlega ekspresji. Proces ten przypomina pod pewnymi względami ekspresję prokariotyczną – genomy mitochondrialne i chloroplastowe są cząsteczkami kolistymi i nie zawierają fragmentów niekodujących. Organelle te zawierają także specyficzne polimerazy, a rybosomy są mniejsze niż te występujące w cytoplazmie (stała sedymentacji rybosomów mitochondrialnych wynosi 55S, a chloroplastowych, podobnie jak bakteryjnych, 70S).
Słownik
(matrycowy RNA, informacyjny RNA lub przekaźnikowy RNA); jeden z rodzajów kwasów rybonukleinowych, który w procesie translacji stanowi matrycę zawierającą informację o sekwencji aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym
specyficzna i powszechna u bakterii strukturalna i funkcjonalna jednostka genomu, zawierająca od dwóch do kilku kolejno ułożonych genów strukturalnych kodujących enzymy jednego szlaku metabolicznego oraz, położone bezpośrednio przed tymi genami, sekwencje operatora i promotora kontrolujące ich aktywność transkrypcyjną;
prekursorowy mRNA; cząsteczka RNA powstała w wyniku procesu transkrypcji, zawierająca kodujące (eksony) oraz niekodujące (introny) sekwencje nukleotydów
proces zachodzący w komórkach organizmów eukariotycznych; jeden z etapów dojrzewania pierwotnych transkryptów; polega na wycinaniu z cząsteczek pre‑mRNA fragmentów niekodujących (intronów) i łączeniu fragmentów kodujących (eksonów); zachodzi w jądrze podczas powstawania mRNA, który następnie przemieszcza się do cytoplazmy i uczestniczy w translacji
współczynnik wyznaczany na podstawie szybkości opadania cząstek koloidalnych poddanych wirowaniu; współczynnik ten stosowany jest do określania masy rybosomów (rybosomy komórek prokariotycznych o stałej sedymentacji 70S określane są jako małe rybosomy, a rybosomy komórek eukariotycznych o stałej sedymentacji 80S – jako duże rybosomy)