Przeczytaj
W przebiegu infekcji wirusowej dochodzi do namnażania się wirusa w komórkach gospodarza. Większość wirusów wnika w całości do wnętrza komórek organizmu. Jedynie bakteriofagibakteriofagi wstrzykują do komórki sam kwas nukleinowy, pozostawiając kapsydkapsyd na zewnątrz. Zainfekowana komórka często ginie, a uwolnione wirionywiriony mogą zakażać kolejne komórki.
Wyróżnia się dwa podstawowe cykle infekcyjne wirusów: cykl lityczny i cykl lizogeniczny. Cykl lityczny jest stosunkowo krótkim cyklem infekcyjnym, który kończy się rozpadem (lizą) komórki gospodarza. Natomiast cykl lizogeniczny nie doprowadza do śmierci komórek i polega na połączeniu materiału genetycznego wirusa z chromosomem gospodarza. Wbudowany w ten sposób wirusowy DNA ulega replikacji przed każdym podziałem komórki, a następnie trafia do kolejnych komórek organizmu.
Więcej informacji na ten temat znajdziesz w e‑materiale pt. Cykle lityczny i lizogeniczny.
Wiele wirusów wykazuje swoistość w odniesieniu do gatunku gospodarza, np. bakteriofag T4 atakuje wyłącznie komórki bakterii pałeczki okrężnicy (Escherichia coli).
Przebieg ekspresji informacji genetycznej w komórce eukariotycznej
DNA jest powielany w procesie replikacji. Replikacja zachodzi przed podziałem komórkowym (podział bakterii czy mitoza i mejoza komórek eukariotycznych). Żeby powstało białko, informacja genetyczna o jego budowie (zawarta w genach w DNA) musi zostać przepisana na RNA w procesie transkrypcjitranskrypcji. Odbywa się to zgodnie z regułą komplementarności zasad azotowych tworzących oba kwasy nukleinowe. Proces transkrypcji jest katalizowany przez enzym polimerazę DNApolimerazę DNA (zwaną transkryptazą). Polimeraza RNA wytwarza nić RNA w oparciu o matrycową nić DNA. Powstająca nić to pre‑mRNA.
Jak wiesz, DNA zawiera fragmenty kodujące informację o białku – eksonyeksony i fragmenty niekodujące – intronyintrony. Aby powstał mRNA, introny muszą zostać usunięte w procesie splicingusplicingu. Sklejone eksony, jako mRNA, zostają przeniesione z jądra do cytoplazmy, gdzie zachodzi kolejny etap ekspresji – translacjatranslacja. Polega ona na przetłumaczeniu kolejności trójek nukleotydów (kodonów) na kolejność aminokwasów w nowo powstającym łańcuchu polipeptydowym.
Przebieg ekspresji informacji genetycznej wirusowego materiału genetycznego
Przebieg ekspresji informacji genetycznej u wirusów zależy od tego, czy mamy do czynienia z wirusem zawierającym DNA, czy RNA.
Wirusy z materiałem genetycznym w postaci DNA (np. wirus ospy wietrznej i półpaśca – Varicella zoster virus, VZV) łączą się z powierzchnią komórki za pomocą glikoproteinowych wypustek. Wypustki te rozpoznają charakterystyczne białka receptorowe komórki. Gdy osłonka wirusa połączy się z błoną komórkową, kapsyd zostaje wprowadzony do wnętrza komórki. Po enzymatycznym strawieniu kapsydu wirusowy DNA dostaje się do jądra komórkowego, gdzie następuje replikacja DNA i transkrypcja na mRNA. Rybosomy zainfekowanej komórki przeprowadzają syntezę białek wirusa. Te agregują się wokół DNA wydzielonego z jądra wirusowego. Siateczka śródplazmatyczna szorstka produkuje glikoproteiny wirusa, które zostają przeniesione na powierzchnię błony komórkowej. Kapsyd z DNA przemieszcza się w kierunku błony i z komórki odpączkowuje wirion, gotowy infekować kolejne komórki.
Materiałem genetycznym niektórych wirusów, m.in. z rodziny retrowirusówretrowirusów (Retroviridae), nie jest jednak DNA, lecz RNA. Również w ich przypadku występują białkowe elementy osłonki rozpoznające odpowiednie receptory na błonie komórkowej, a kapsyd wprowadzany jest do komórki. Jednak sposób kopiowania informacji genetycznej nie może zachodzić według schematu: DNA – RNA – białko.
Odwrotna transkrypcja jako etap cyklu infekcyjnego wirusów RNA
W kapsydzie retrowirusów (do których należy m.in. ludzki wirus niedoboru odporności – HIV, ang. human immunodeficiency virus), poza RNA, znajduje się specjalny enzym − odwrotna transkryptazaodwrotna transkryptaza. Umożliwia ona wbudowanie informacji genetycznej wirusa w DNA komórki poprzez katalizowanie procesu syntezy jednoniciowego DNA w oparciu o wirusowe RNA. Dzięki temu powstaje hybryda DNA–RNA. Następnie rybonukleaza uwalnia nowo powstały jednoniciowy DNA (ssDNA – ang. single‑stranded DNA), a polimeraza DNA syntetyzuje na ssDNA drugą, komplementarną nić. Powstaje dwuniciowy DNA (dsDNA – double‑stranded DNA), który zostaje wprowadzony do jądra zainfekowanej komórki i – przy udziale enzymu integrazyintegrazy – wbudowany do jądrowego DNA.
Dalsze etapy procesu ekspresji genetycznej przebiegają tak samo jak w przypadku wirusów DNA. Wirusowy DNA jest transkrybowany na wirusowe RNA. RNA opuszcza jądro. Rozpoczyna się synteza białek kapsydu, które agregują wokół fragmentów RNA. Tworzy się nowy wirion, który odpączkowuje, tworząc otoczkę z błony komórkowej zainfekowanej komórki.
Koronawirusy (m.in. SARS‑CoV‑2) zawierają materiał genetyczny w postaci pojedynczej nici RNA. Jest on rozpoznawany przez rybosomy gospodarza i bezpośrednio na jego podstawie produkowane są wirusowe białka. Jednym z najważniejszych jest polimeraza RNA zależna od RNA, która umożliwia replikowanie materiału genetycznego wirusa. Koronawirusy namnażają się więc bez konieczności przepisywania RNA na DNA i bez udziału odwrotnej transkryptazy.
Słownik
fagi; wirusy, których naturalnym gospodarzem są bakterie; struktura bakteriofagów jest typowa dla innych wirusów – genom jest zbudowany z jedno- lub dwuniciowego DNA lub RNA, kodujących od 3 do ponad 200 białek, zawarty w kapsydzie zbudowanym z jednego lub kilku rodzajów białek; cykl życiowy bakteriofagów jest podobny do innych wirusów
odcinki DNA kodujące informację o budowie białek
pęcherzyki, wakuole lub cysterny ograniczone pojedynczą błoną śródplazmatyczną, tworzące się w procesie endocytozy i występujące w komórkach eukariotycznych
łączenie węglowodanów ze związkami organicznymi (np. białkami) z wytworzeniem wiązania glikozydowego
enzym kodowany przez niektóre wirusy, katalizujący reakcję integracji dwóch różnych cząsteczek DNA
odcinki DNA przepisywane w procesie transkrypcji na mRNA, ale niekodujące białek
białkowa osłonka kwasu nukleinowego (genomu) wirusa
enzym, polimeraza DNA zależna od RNA, przeprowadzająca reakcję odwrotnej transkrypcji
enzym katalizujący syntezę DNA w czasie replikacji; syntetyzuje nową nić polinukleotydową, komplementarną do nici macierzystej powielanej cząsteczki DNA
wirus należący do rodziny Retroviridae, którego materiałem genetycznym jest RNA; przeprowadza proces odwrotnej transkrypcji; retrowirusy wywołują wiele chorób, np. AIDS, nowotwory
proces obróbki pierwotnego produktu transkrypcji prekursorowego RNA (preRNA); polega na wycinaniu odcinków RNA niekodujących białka (intronów) i łączeniu we właściwej kolejności odcinków kodujących (egzonów); w procesie tym nieciągła informacja genetyczna zawarta w DNA zostaje przekształcona w ciągłą
przepisanie kolejności nukleotydów z DNA na RNA
przetłumaczenie kolejności kodonów na kolejność aminokwasów w nowo powstającym białku
zmiana struktury chromosomów polegająca na przemieszczeniu fragmentu z jednego chromosomu na inny chromosom niehomologiczny; do tej aberracji może dojść w wyniku pęknięcia dwóch chromosomów i ich nieprawidłowej naprawy lub przypadkowej rekombinacji pomiędzy dwoma chromosomami niehomologicznymi podczas mejozy
kompletna cząstka wirusowa o złożonej budowie; składa się z kwasu nukleinowego (DNA lub RNA), stanowiącego rdzeń, oraz otoczki białkowej, czyli kapsydu, i niekiedy z dodatkowej osłonki zewnętrznej otaczającej kapsyd