Bakterie brodawkowe z rodzaju Rhiziobium i Bradyrhizobium tworzą związek z korzeniami roślin motylkowych Fabaceae, do których należy np. koniczyna łąkowa Trifolium, soja Glycine, groch Pisum, łubin Lupinus, lucerna Medicago i wyka Vicia. Bakterie brodawkowe wnikają do korzeni roślin motylkowych, w wyniku czego powstają brodawki. Zapewniają one bakteriom warunki beztlenowe niezbędne do wiązania niedostępnego dla roślin azotu atmosferycznego NIndeks dolny 2₂. W zamian za to rośliny uzyskują dostęp do jonów amonowych (NHIndeks dolny 4₄Indeks górny +⁺) i azotanowych (NOIndeks dolny 3₃Indeks górny -^-), które wykorzystują do produkcji białek.

Roślinożerne owady Insecta np. termity Isoptera lub ssaki przeżuwacze Ruminantia np. łoś europejski Alces alces , żyrafa Giraffa camelopardalis, bydło domowe Bos taurus taurus) pozostają w ścisłej zależności z mikroorganizmami zasiedlającymi przewód pokarmowy i posiadającymi enzymy trawiące celulozę. Większość roślinożerców nie mogłaby korzystać z pokarmu roślinnego, gdyby nie ta współpraca. Mikroorganizmy trawią dla roślinożerców celulozę, a te zapewniają im odpowiednie warunki do życia i stałe dostawy materiału roślinnego.

Mrówki grzybiarki lub mrówki parasolowe to wspólna nazwa dla około 230 różnych amazońskich gatunków mrówek, wyspecjalizowanych w hodowli własnych grzybów, którymi się odżywiają. Należą do nich mrówki z rodzaju Acromyrmex i rodzaju Atta. Współżycie grzybów i uprawiających je mrówek jest przykładem mutualizmu obligatoryjnego. Niektóre gatunki opisywanych mrówek współpracują z promieniowcami Actinobacteria, bakteriami z rodzaju Streptomyces. Bakterie mieszkają w niewielkim wgłębieniu w ich pancerzu i wytwarzają substancje grzybobójcze oraz antybiotyki. Chronią kolonię mrówek przed chorobami, ale ochraniają także ich uprawę hamując rozwój niepożądanych grzybów w mrowisku.

Przykładem mutualizmu obligatoryjnego jest mikoryza - ścisła zależność między grzybem i korzeniami roślin. Grzyb dostarcza korzeniom wodę i sole mineralne (głównie fosforany, azot i potas), a w zamian od rośliny otrzymuje związki organiczne. Mikoryza jest szczególnie istotna dla roślin, które rosną na glebach ubogich.

U wielu dziko żyjących roślin i roślin uprawnych występuje endomikoryza (mikoryza endotroficzna), polegająca na wnikaniu strzępek grzyba do komórek korzenia.

U drzew wystepuje głównie ektomikoryza (mikoryza ektotroficzna), która polega na tworzeniu opilśniopilśńopilśni, czyli oplataniu korzenia przez strzępki grzyba.