Przeczytaj
Pierwszymi organizmami, które zasiedliły Ziemię 3,5 miliarda lat temu, były prokarionty.
Podczas długiej historii ewolucyjnej prokarionty żyjące w wielu środowiskach podlegały – i podlegają nadal – doborowi naturalnemu. Dzięki temu wykształciły różnorodne przystosowania, które umożliwiły im przetrwanie.
Budowa komórki bakteryjnej
Większość bakterii to organizmy jednokomórkowe. Jednak niektóre gatunki po podziale komórkowym pozostają połączone. Wielkość komórek bakteryjnych to zwykle 0,5‑5 µm – są zatem znacznie mniejsze, niż komórki eukariotyczne.
Model 3D komórki bakteryjnej.
1. Nukleoid. To podwójna helisa DNA tworząca strukturę kolistą. W nukleoidzie znajduje się informacja genetyczna bakterii. Inaczej niż w komórkach eukariotycznych DNA bakterii nie jest upakowane na białkach histonowych.
2. Fimbrie. Są białkowymi wyrostkami cytoplazmatycznymi, za pomocą których bakteria przyczepia się do podłoża, np. do komórki roślinnej, zwierzęcej lub innej powierzchni.
3. Pila. Pile są nieco grubszymi od fimbrii białkowymi rurkami. Uczestniczą w procesie koniugacji – wymianie materiału genetycznego pomiędzy komórkami bakterii.
4. Wić. Wić umożliwia komórkom bakteryjnym ruch. Budową przypomina pustą w środku rurkę, której ściana stworzona jest z flagelliny.
5. Materiał zapasowy. Bakterie magazynują substancje takie jak: glikogen, polifosforan, siarka lub polihydroksyalkaniany w formie ziaren, z których mogą być uwalniane w razie potrzeby.
6. Rybosom. We wnętrzu komórki bakteryjnej występują rybosomy typu 70S, takie same jak w chloroplastach i mitochondriach. Biorą one udział w syntezie białek.
7. Cytoplazma. Płynna substancja wypełniająca wnętrze komórki. Cytoplazma komórek bakteryjnych nie jest podzielona na sektory ze względu na brak błoniastych organelli, m.in. siateczki śródplazmatycznej.
8. Błona komórkowa. Struktura oddzielająca środowisko wewnętrzne komórki bakterii od świata zewnętrznego.
9. Ściana komórkowa. Ściana komórkowa bakterii utworzona jest z mureiny. Jej zadaniem jest utrzymywanie kształtu komórki oraz ochrona przed czynnikami środowiska zewnętrznego.
10. Błona zewnętrzna. Występuje u bakterii Gram‑ujemnych. Znajdują się w niej fosfolipidy, białka i lipopolisacharydy.
11. Otoczka śluzowa. Ściana komórkowa niektórych bakterii pokryta jest otoczką o konsystencji śluzu. Pełni ona funkcję ochronną zarówno przed wysychaniem, jak i szkodliwymi czynnikami zewnętrznymi.
12. Plazmid. Plazmid to kolista lub liniowa cząsteczka DNA. Występuje u prokariontów oraz u drożdży. Nie warunkuje cech umożliwiających przeżycie, jednak niesie pożyteczne cechy np. oporność na antybiotyki, czynnik płciowy (czynnik F) czy możliwość syntezy toksyn.
Ściana komórkowa większości bakterii zbudowana jest z mureiny (peptydoglikanu). Mureinę budują łańcuchy polisacharydowe i peptydy. Odpowiada ona za kształt komórki i zapobiega jej zniszczeniu, np. jest odpowiedzialna za antybiotykooporność.
Istnieją bakterie, które nie posiadają ściany komórkowej. MykoplazmyMykoplazmy (Mycoplasmatales), najmniejsze znane obecnie bakterie, nie tworzą peptydoglikanów – bez nich powstanie ściany nie jest możliwe.
Bakterie możemy podzielić na Gram‑dodatnie czyli takie, które barwią się na fioletowo po zastosowaniu metody Grama, i bakterie Gram‑ujemne czyli takie, które po zastosowaniu tej metody przybierają kolor różowy. Bakterie Gram‑ujemne i Gram‑dodatnie różnią się budową ściany komórkowej.
Ściana komórkowa wielu bakterii (zarówno Gram‑ujemnych, jak i Gram‑dodatnich) jest otoczona dodatkową strukturą właściwą tylko dla bakterii – otoczką śluzową. Ta lepka, śluzowata warstwa zbudowana jest zazwyczaj z polisacharydów. Umożliwia prokariontom zlepianie się w kolonie lub przywieranie do podłoża. Może również chronić przed utratą wody albo przed atakiem ze strony układu odpornościowego gospodarza.
Bakterie Gram‑ujemne mogą przylegać do podłoża lub siebie nawzajem za pomocą fimbriifimbrii. Są to liczne, włosowate wypustki cytoplazmatyczne zbudowane z białek. Oprócz nich występują mniej liczne, ale za to dłuższe wypustki – pilepile. Uczestniczą one w przekazywaniu DNA pomiędzy dwiema komórkami podczas koniugacjikoniugacji.
Strukturą umożliwiającą prokariontom poruszanie się jest wić. Wici mogą występować na całej powierzchni komórki, na jej jednym lub obu końcach. Te u bakterii i archeowców maja podobną długość i mechanizm napędzający. Różnią się składem białek, które je budują. Wić zakotwiczona jest w błonie komórkowej za pomocą złożonej struktury, tzw. rotoru, nadającego jej ruch obrotowy. Wić niczym śruba okrętowa popycha komórkę do przodu. Ruchy komórek bakteryjnych nazywa się taksjami. Przykładem bakterii w ogóle pozbawionych organelli ruchu są sinice.
Błona komórkowa bakterii nieco różni się budową od typowej, podwójnej błony fosfolipidowej komórek eukariotycznych – pozbawiona jest cholesterolu. Składa się ze znikomych ilości choliny i kwasów nienasyconych. Dodatkowo w błonie znajdują się enzymy i inne białka przenoszące elektrony w łańcuchu oddechowym. Prokarionty nie mają jądra komórkowego i organelli komórkowych, takich jak mitochondria i plastydy. Pozbawione są też struktur błoniastych, np. błon retikulum endoplazmatycznego.
W cytoplazmie bakterii występują rybosomy będące miejscem syntezy białka. Są one rozrzucone po całej cytoplazmie. U prokariontów występują rybosomy 70S, które zbudowane są z dużej podjednostki o stałej sedymentacji 50S i małej o stałej sedymentacji 30S.
U prokariontów samożywnych (m.in. u fotosyntetyzujących sinic) występują chromatofory. Mają one postać spłaszczonych woreczków (tylakoidów) rozmieszczonych zwykle w peryferyjnych częściach komórki. Struktury te pełnią funkcję chloroplastów, ale mają prostszą budowę. Znajduje się w nich głównie chlorofil a, ale także żółty beta-karoten, czerwona fikoerytryna i niebieska fikocyjanina. Barwniki te nadają sinicom charakterystyczny sinozielony kolor. Fotosyntezę przeprowadzają też bakterie żyjące w osadach dennych, np. bakterie zielone. Ich barwniki fotosyntetyczne to bakteriochlorofil i karotenoidy.
W komórkach sinic występuje również skrobia sinicowa – materiał zapasowy będący polisacharydem przypominającym amylopektynę i glikogen.
Funkcję jądra komórkowego spełnia „chromosom bakteryjny” – genoforgenofor. To koliście zwinięta podwójna helisa kwasu deoksyrybonukleinowego. Występuje na obszarze cytoplazmy nazywanym nukleoidemnukleoidem, nieoddzielonym od reszty protoplastu błoną. Genofor zawiera niemal wyłącznie sekwencje kodujące białka (eksonyeksony); brak w nim fragmentów niekodujących (intronówintronów). Komórka prokariotyczna może dodatkowo zawierać o wiele krótsze, koliste cząsteczki niezależnie replikującego się DNA nazywane plazmidami, z których większość koduje tylko kilka genów. Od obecności genów zawartych w plazmidach może zależeć m.in. chorobotwórczość bakterii, oporność na metale ciężkie czy na antybiotyki. Istnienie plazmidów z genami oporności na antybiotyki umożliwia bakteriom szybkie przenoszenie tej cechy między różnymi szczepami w procesie koniugacji.
Za oddychanie komórkowe w komórce odpowiada błona komórkowa. Wcześniej uważano, że funkcję tę pełnią drobne twory – mezosomymezosomy. Gradient stężenia jonów wodorowych powstający w poprzek błony komórkowej stanowi źródło energii do syntezy ATP.
Kształty komórek bakterii i kolonii bakteryjnych
Ziarniaki to kuliste bakterie, które mogą występować pojedynczo, w parach, w długich łańcuchach oraz w grupach: gronkowce, pakietowce lub tetrady (czworaczki).
Bakterie pałeczkowate najczęściej występują pojedynczo, ale mogą też łączyć się w łańcuchy.
Bakterie o kształtach spiralnych mają komórki o różnej liczbie i wielkości skrętów – od pojedynczych, przypominających przecinek, do długich skrętów w formie korkociągu.
Formy przetrwalnikowe bakterii
W niekorzystnych warunkach środowiska bakterie mają zdolność zwalniania swojego metabolizmu i wytwarzania specjalnych form przetrwalnikowych. Wyróżnia się dwie główne formy przetrwalnikowe bakterii:
endosporyendospory, które powstają przez podzielenie komórki na dwie części: większą i mniejszą, przy czym mniejsza staję się przetrwalnikiem poprzez otoczenie się grubą ścianą. Pozostała część komórki ulega degeneracji. Proces tworzenia endospory to sporulacjasporulacja;
cystycysty, które powstają przez odwodnienie cytoplazmy i otoczenie grubą ścianą komórkową: błony komórkowej, rybosomów i genoforu.
Bakterie i archeowce
Bakterie to najliczniejsza grupa prokariontów. Archeowce są grupą, która zawiera cechy bakterii i eukariontów.
Archeowce mogą żyć w środowiskach tak ekstremalnych, że tylko nieliczne inne organizmy są w stanie tam przetrwać. Tego typu organizmy nazywa się ekstremofilamiekstremofilami. Wśród nich wyróżnia się ekstremalne halofilehalofile i termofiletermofile.
Znaczenie archeowców
Gatunki metanogenówmetanogenów zamieszkują środowiska beztlenowe w jelitach bydła, termitów i innych roślinożerców, odgrywając zasadniczą rolę w procesie odżywiania tych zwierząt. Występują również w jelicie człowieka, usprawniając procesy fermentacyjne wielocukrów, co prowadzi do zwiększenia ilości pozyskiwanej z nich energii. U osób otyłych flora jelitowa jest bogata w metanogeny. Przez to dochodzi do wzrostu pozyskiwanej z pożywienia energii i – co za tym idzie – pogłębienia otyłości.
Metanogeny znalazły zastosowanie w oczyszczalniach ścieków. Należą one do chemolitotrofówchemolitotrofów, czyli organizmów wykorzystujących związki nieorganiczne jako donory elektronów w procesie oddychania komórkowego. Obecne badania wskazują, że niektóre z archeowców przeprowadzają nitryfikacjęnitryfikację w oceanach i mogą mieć ogromny udział w krążeniu azotu w przyrodzie. W autotroficznych ekosystemach kominów hydrotermalnych na dnie oceanów, tam gdzie nie dociera światło, archeowce odpowiadają za wytwarzanie materii organicznej w procesie chemosyntezychemosyntezy.
Bakterie jelitowe
Naukowcy szacują, że organizm człowieka zasiedla ok. 10Indeks górny 1414 komórek mikroorganizmów. Ich największą niszę stanowią jelita. Występują w nich bakterie Gram‑dodatnie, Gram‑ujemne, drożdże, a nawet archeowce! Badania wykazały obecność metanu w wydychanym przez ludzi powietrzu - jest to możliwe dzięki obecności metanogennych drobnoustrojów wewnątrz ciała.
Ekstremalny termofil Pyrococcus furiosus używany jest w biotechnologii jako źródło polimerazy DNA używanej w łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR). Reakcja ta pozwala na uzyskanie wielu kopii materiału genetycznego w bardzo krótkim czasie. Znalazło to zastosowanie w wielu dziedzinach życia, np. umożliwiło stworzenie genetycznego „odcisku palca” poprzez wykazanie różnic w sekwencji DNA osobników tego samego gatunku. Stało się też najczęściej stosowaną techniką w badaniach ojcostwa.
Bakterie poruszają się dzięki ruchom wici. Przecinkowiec cholery w ciągu minuty może pokonać 1 cm! W sytuacji zagrożenia bakterie potrafią odrzucić wić, podobnie jak jaszczurka odrzuca ogon. Wić rośnie nieprzerwanie, a jej ruch pochłania sporo energii. W sytuacji niedoboru substancji odżywczych bakterie nie są w stanie jej odbudować, przez co poruszają się wolniej. Ruch wici możliwy jest dzięki skorelowanej pracy zestawu białek tworzącego swoisty „silnik” umożliwiający poruszanie długą i spiralną wicią. Praca białek jest modelowana dzięki obecności chemoreceptorów, które rejestrują różnice stężenia substancji odżywczych w otoczeniu. „Silnik” rotacyjny, czyli protonowy, jest napędzany przez strumień protonów (jonów wodoru) płynących z zewnątrz do wnętrza bakterii. Bakteryjny silnik protonowy uważany jest za najbardziej wydajną strukturę świata!
Indeks górny Na podstawie: Wiedza i Życie, maj 2019, nr 5 (1013). Indeks górny koniecNa podstawie: Wiedza i Życie, maj 2019, nr 5 (1013).
Rotacyjny ruch wici bakterii Gram‑ujemnych możliwy jest dzięki rotacji pierścieni oraz rotora. Energia z rotacji przekazywana jest następnie do haka, a później do wici, zbudowanej z białka – flagelliny.
Słownik
proces, w którym energia jest pozyskiwana z utleniania nieorganicznych związków zredukowanych, takich jak np. NHIndeks dolny 33 lub NOIndeks dolny 22; akceptorami elektronów z łańcucha oddechowego są tlen, związki nieorganiczne lub organiczne
jeden ze sposobów samożywności, w którym dochodzi do utleniania związków nieorganicznych lub metanu. Składa się z dwóch etapów. Pierwszy to utlenienie związku chemicznego, a drugi to związanie COIndeks dolny 22 i synteza glukozy
rodzaj przetrwalnika powstający u wielu organizmów niższych (bakterii, protistów roślinnych, śluzowców) w celu przetrwania niekorzystnych dla życia warunków (np. suszy, niskiej temperytury lub braku składników odżywczych); komórki lub części ciała przekształcające się w cystę ulegają odwodnieniu i otaczają się grubą ścianą komórkową
spoczynkowe formy bakterii powstające w niekorzystnych do wzrostu warunkach środowiska, takich jak brak substancji odżywczych lub odwodnienie; zdolność do wytwarzania endospor mają bakterie z rodzajów Bacillus, Clostridium, Sporosarcina oraz Coxiella burneti
organizm żyjący w środowisku, w którym warunki są tak trudne, że niewiele innych organizmów może tam przetrwać
odcinek genu kodujący sekwencję aminokwasów w polipeptydzie lub sekwencję nukleotydów w RNA
(łac. fimbria ); frędzla, krótka, włosowata struktura komórki prokariotycznej, która pomaga jej przylegać do podłoża lub innej komórki
chromosom bakteryjny; materiał genetyczny komórki bakteryjnej; dwuniciowy DNA w formie kolistej helisy, zanurzony w cytoplazmie i bezpośrednio stykający się z jej składnikami; jest nośnikiem genów bakterii, odpowiednikiem chromosomów eukariotycznych, w odróżnieniu od nich prawie cały nukleoid zawiera sekwencje kodujące
(gr. hals – sól, phileo - lubię); organizm, który żyje w wysoko zasolonym środowisku
odcinek genu niekodujący sekwencji aminokwasów w polipeptydzie; rozdziela eksony w genach komórek eukariotycznych
mechanizm wymiany DNA między komórkami bakterii, podczas koniugacji materiał genetyczny jest przekazywany poprzez pile płciowe (fimbrie)
organizm, który produkuje metan, jako produkt uboczny pozyskiwania energii w procesie oddychanie beztlenowego
(gr. mesos – środkowy, soma – ciało); artefakt komórki prokariotycznej w formie wpuklenia błony komórkowej będący efektem działań środków chemicznych używanych do mikroskopowania
bakterie z rzędu Mycoplasmatales; najmniejsze bakterie wolno żyjące zawierające skrajnie mały genom; nie mają ściany komórkowej i charakterystycznego dla innych bakterii peptydoglikanu, błona komórkowa zawiera dużą ilość steroli; ok. 15 gat. mykoplazm jest składnikiem mikroflory stałej lub przejściowej człowieka, najczęściej kolonizując błony śluzowe jamy ustnej i dróg moczowych; są znanymi patogenami roślin i zwierząt
proces przeprowadzany przez bakterie nitryfikacyjne, podczas którego dochodzi do utlenienia amoniaku i soli amonowych do azotanów i azotynów
(łac. nucleus – jądro, gr. eidos – wygląd, postać); nieotoczony błoną region w komórce prokariotycznej, w którym zlokalizowany jest materiał genetyczny w postaci kolistej, dwuniciowej cząsteczki DNA - genofor, tzw. „chromosom bakteryjny”
fimbria płciowa, włosowata struktura, która łączy dwie komórki ze sobą na początku koniugacji
(gr. plasma – to, co utworzone, twór, eidos - wygląd, postać); mała, kolista cząsteczka DNA replikująca się niezależnie od reszty materiału genetycznego
miejsce w ścianie komórkowej bakterii Gram‑ujemnych, znajdujące się pomiędzy błoną zewnętrzną, a błoną cytoplazmatyczną
proces tworzenia przetrwalników (endospor) u bakterii
(gr. thermos – ciepły, gorący, phileo – lubię); organizm, który żyje w gorącym środowisku w temperaturze 60Indeks górny ooC i więcej