bg‑cyan

Transkrypcyjny kompleks inicjacyjny

Inicjacja transkrypcji jest kluczowym etapem w ekspresji danego genu. Następuje po rozluźnieniu struktury chromatyny i polega na wiązaniu się odpowiednich białek do DNA w celu aktywacji bądź zmniejszenia poziomu transkrypcji. Transkrypcyjny kompleks inicjacyjnytranskrypcyjny kompleks inicjacyjnyTranskrypcyjny kompleks inicjacyjny może zawierać nawet ok. 100 białek. W jego skład wchodzą: polimeraza RNA, ogólne czynniki transkrypcyjneczynniki transkrypcyjneczynniki transkrypcyjne oraz inne białka umożliwiające polimerazie RNA przyłączenie się do miejsca promotorowego genu.

bg‑cyan

Ogólne czynniki transkrypcyjne

W komórkach eukariotycznych transkrypcja większości genów odbywa się niezależnie od innych, ponieważ geny nie są zorganizowane w operony. Natomiast wspólnym elementem kontroli tego procesu jest konieczność obecności aktywnych białek zaliczanych do ogólnych czynników transkrypcyjnych. Białka te mogą łączyć się bezpośrednio ze znajdującą się w promotorze sekwencją TATAsekwencja TATAsekwencją TATA, ze sobą nawzajem lub z polimerazą RNA. Oddziaływania pomiędzy nimi i DNA są niezbędne do rozpoczęcia transkrypcji. Ogólne czynniki transkrypcyjne tworzą tzw. kompleks preinicjacyjny. Z kolei występowanie specyficznych czynników transkrypcyjnych pozwala na regulację poziomu transkrypcji.

RvCiAB3M6dNrj1
Struktura ogólnego czynnika transkrypcyjnego przyłączanego do sekwencji TATA.
Białko, łącząc się z sekwencją TATA, powoduje wygięcie DNA, co umożliwia polimerazie RNA odpowiednie ulokowanie się na jego nici.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
bg‑gray1
Ciekawostka

Ogólne czynniki transkrypcyjne mające podobne właściwości zostały wyizolowane nie tylko z komórek ludzkich, ale także z wątroby szczura, zarodków muszki owocowej oraz komórek drożdży. Czynniki te wykazują między sobą wysoką zgodność, co oznacza, że ich sekwencje są do siebie podobne. Występuje zatem duży stopień konserwacji ewolucyjnej w ich obrębie – pozostają one niezmienne lub podlegają niewielkiej zmianie. Świadczy to o ich ogromnym znaczeniu dla funkcjonowania komórki.

bg‑cyan

Specyficzne czynniki transkrypcyjne

Za samą inicjację transkrypcji genów odpowiadają ogólne czynniki transkrypcyjne, natomiast przyspieszenie lub hamowanie transkrypcji możliwe jest dzięki aktywności białek należących do grupy specyficznych czynników transkrypcyjnych. Białka te łączą się z DNA w pobliżu promotorów albo w miejscach określanych jako dystalne elementy kontrolne, które pełnią funkcję wzmacniaczy (enhancerów)wzmacniacze (enhancery)wzmacniaczy (enhancerów). Wzmacniacze mogą znajdować się tysiące nukleotydów od genu, a także wewnątrz intronów. Poszczególne geny mogą zawierać wiele wzmacniaczy, które są aktywne w różnych komórkach w różnym czasie, a łączące się z nimi specyficzne czynniki transkrypcyjne mogą pełnić funkcję aktywatorówaktywatoraktywatorów lub represorówrepresorrepresorów transkrypcji. Przyłączone do wzmacniaczy aktywatory ułatwiają przyłączenie białka wyginającego DNA oraz wiążą się z białkami mediatorowymibiałka mediatorowebiałkami mediatorowymi, które z kolei oddziałują z białkami tworzącymi kompleks preinicjacyjny. Te zwielokrotnione oddziaływania między różnymi białkami regulacyjnymi pośredniczą w odpowiednim wygięciu się nici DNA, prowadząc do przyłączenia się polimerazy RNA i rozpoczęcia transkrypcji.

Natomiast białka represorowe mogą hamować syntezę mRNA poprzez:

  • połączenie się ze wzmacniaczami, co blokuje wiązanie się aktywatorów do tych sekwencji DNA;

  • uniemożliwienie oddziaływań pomiędzy różnymi białkami zaangażowanymi w tworzenie się transkrypcyjnego kompleksu inicjacyjnego.

Ogólne czynniki transkrypcyjne są aktywne w komórce przez cały czas, ponieważ biorą udział w inicjacji transkrypcji wielu różnych genów. Z kolei specyficzne czynniki transkrypcyjne są aktywne tylko wtedy, kiedy komórka odbierze sygnał, który determinuje konieczność wzmocnienia lub zahamowania transkrypcji danego genu. Wiąże się to np. z zapotrzebowaniem na dane białko, które pozwoli na przetrwanie niesprzyjających warunków środowiska.

R1ijUUDR7duvK1
Ilustracja interaktywna przedstawia w trzech etapach tworzenie się transkrypcyjnego kompleksu inicjacyjnego. Na pierwszej ilustracji cząsteczka DNA jest wyprostowana. Po prawej stronie oznaczony jest gen, a tuż przed nim promotor z zaznaczoną sekwencją TATA. Po lewej stronie, w odległości od genu i promotora zaznaczony jest wzmacniacz (dystalny element kontrolny), do którego przyłączone są aktywatory (specyficzne czynniki transkrypcyjne). Obok napis interaktywny: 1. Aktywatory łącza się z dystalnymi elementami kontrolnymi, tworzącymi wzmacniacz. Druga ilustracja przedstawia tę samą cząsteczkę DNA, wygiętą w rejonie pomiędzy wzmacniaczem, a genem i promotorem przez białko wyginające DNA. Wygięcie DNA powoduje zbliżenie się wzmacniacza z przyłączonymi aktywatorami do rejonu promotora. Pomiędzy nimi znajduje się grupa białek mediatorowych, a obok ogólne czynniki transkrypcyjne. Poniżej znajduje się polimeraza RNA. Napis interaktywny: 2. Białko wyginające DNA powoduje zbliżenie się aktywatorów do promotora genu. W trzecim etapie aktywatory związane do wzmacniacza przyłączone są do grupy białek mediatorowych, a te do promotora. W tym samym miejscu przyłączona jest polimeraza RNA z ogólnym czynnikiem transkrypcyjnym. Poniżej podpis: Transkrypcyjny kompleks inicjalny oraz zapis: synteza RNA ze strzałką w kierunku od promotora wzdłuż genu. Powyżej zapis interaktywny: 3. Aktywatory łączą się z białkami mediatorowymi oraz ogólnymi czynnikami transkrypcyjnymi umożliwiając przyłączenie się polimerazie RNA z promotorem.
Model tworzenia się transkrypcyjnego kompleksu inicjacyjnego.
Źródło: Englishsquare.pl Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.

Słownik

aktywator
aktywator

białko o charakterze regulacyjnym, indukujące proces transkrypcji genu

białka mediatorowe
białka mediatorowe

kompleks składający się z wielu białek działających jako czynniki współuczestniczące w inicjacji transkrypcji

czynniki transkrypcyjne
czynniki transkrypcyjne

białka kontrolujące poziom transkrypcji poprzez łączenie się ze specyficznymi sekwencjami DNA lub innymi białkami; dzielą się na ogólne oraz specyficzne; wśród specyficznych czynników transkrypcyjnych wyróżnia się aktywatory – pobudzające transkrypcję oraz represory – hamujące transkrypcję

represor
represor

białko o charakterze regulacyjnym, wpływające na zahamowanie procesu transkrypcji genu

sekwencja TATA
sekwencja TATA

sekwencja DNA znajdująca się w promotorze genu, stanowiąca miejsce inicjacji transkrypcji

transkrypcyjny kompleks inicjacyjny
transkrypcyjny kompleks inicjacyjny

kompleks białek niezbędny do rozpoczęcia transkrypcji genów kodujących białka, składający się z polimerazy RNA oraz ogólnych czynników transkrypcyjnych

wzmacniacze (enhancery)
wzmacniacze (enhancery)

krótkie segmenty DNA stanowiące miejsce przyłączania się specyficznych czynników transkrypcyjnych, aktywatorów lub represorów transkrypcji