Sprawdź się

Pokaż ćwiczenia:

R1BjWAKzy1D5d1

Ćwiczenie 1

Na czym polega idea barkodingu DNA? Możliwe odpowiedzi: 1. Na wykorzystaniu informacji genetycznej zawartej w genomie organizmu jako znacznika do identyfikacji organizmu., 2. Na sekwencjonowaniu genomu., 3. Jest to technika, umożliwiająca wprowadzanie losowych mutacji w DNA., 4. Jest to technika, służąca do wykrywania położenia mutacji.

Rwb2gT8sgzd3y1

Ćwiczenie 2

Jakie kryteria musi spełniać sekwencja wykorzystywana do barkodingu DNA? Możliwe odpowiedzi: 1. Musi wykazywać niską zmienność w obrębie gatunków, a równocześnie wysoką na poziomie międzygatunkowym., 2. Musi być krótka, aby fragment mógł być sekwencjonowany w pojedynczym odczycie., 3. Sekwencja nie powinna być oflankowana przez wysoce konserwowane regiony., 4. Sekwencje nie może występować w genomie w dużej liczbie kopii.

R25s5jpbIvxRP2

Ćwiczenie 3

Standardowym barkodem DNA dla wszystkich zwierząt jest fragment genu, kodującego enzym 1. peroksydazę chrzanową, 2. częste, 3. nie jest, 4. powierzchniowe, 5. oksydazę cytochromu c, 6. rzadkie, 7. zakotwiczone, 8. jest, 9. oksydazę glukozową, 10. transbłonowe. Enzym ten to białko 1. peroksydazę chrzanową, 2. częste, 3. nie jest, 4. powierzchniowe, 5. oksydazę cytochromu c, 6. rzadkie, 7. zakotwiczone, 8. jest, 9. oksydazę glukozową, 10. transbłonowe, znajdujące się w mitochondrium i 1. peroksydazę chrzanową, 2. częste, 3. nie jest, 4. powierzchniowe, 5. oksydazę cytochromu c, 6. rzadkie, 7. zakotwiczone, 8. jest, 9. oksydazę glukozową, 10. transbłonowe wysoce konserwowane ewolucyjnie. Ponadto mutacje, takie jak insercje czy delecje, są 1. peroksydazę chrzanową, 2. częste, 3. nie jest, 4. powierzchniowe, 5. oksydazę cytochromu c, 6. rzadkie, 7. zakotwiczone, 8. jest, 9. oksydazę glukozową, 10. transbłonowe w przypadku tego markera.

RtrvSiAKQFxRj2

Ćwiczenie 4

Uporządkuj kolejne etapy barkodowania. Elementy do uszeregowania: 1. Założenie hodowli komórkowej, 2. Przeprowadzenie elektroforezy na żelu agarozowym, 3. Sekwencjonowanie DNA, 4. Porównanie uzyskanych sekwencji z sekwencjami dostępnymi w bazach danych, 5. Izolacja DNA, 6. Pobieranie próbek środowiskowych, 7. Powielenie pożądanego fragmentu przy pomocy PCR

RkYXeCe6OOxll2

Ćwiczenie 5

Łączenie par. Wskaż zdania prawdziwe i zdania fałszywe. Barkod DNA jest inaczej nazywany kodem kreskowym DNA.. Możliwe odpowiedzi: Prawda, Fałsz. Cząsteczki nDNA są zazwyczaj koliste.. Możliwe odpowiedzi: Prawda, Fałsz. Materiał do analiz laboratoryjnych barkodingu DNA może być materiałem kopalnym.. Możliwe odpowiedzi: Prawda, Fałsz. Sekwencjonowanie DNA polega na ustaleniu kolejności nukleotydów w łańcuchach kwasów nukleinowych.. Możliwe odpowiedzi: Prawda, Fałsz

RiwtE7TJF0FZN2

Ćwiczenie 6

Połącz w pary nazwy pojęć i ich definicje. genom Możliwe odpowiedzi: 1. materiał genetyczny kodujący większość informacji genetycznej organizmu, 2. metoda rozdziału mieszaniny związków chemicznych w polu elektrycznym, 3. materiał genetyczny zawarty w podstawowym (haploidalnym) zespole chromosomów, 4. metoda powielania łańcuchów DNA polegająca na łańcuchowej reakcji polimerazy DNA w wyniku wielokrotnego podgrzewania i oziębiania próbki jądrowy DNA Możliwe odpowiedzi: 1. materiał genetyczny kodujący większość informacji genetycznej organizmu, 2. metoda rozdziału mieszaniny związków chemicznych w polu elektrycznym, 3. materiał genetyczny zawarty w podstawowym (haploidalnym) zespole chromosomów, 4. metoda powielania łańcuchów DNA polegająca na łańcuchowej reakcji polimerazy DNA w wyniku wielokrotnego podgrzewania i oziębiania próbki PCR Możliwe odpowiedzi: 1. materiał genetyczny kodujący większość informacji genetycznej organizmu, 2. metoda rozdziału mieszaniny związków chemicznych w polu elektrycznym, 3. materiał genetyczny zawarty w podstawowym (haploidalnym) zespole chromosomów, 4. metoda powielania łańcuchów DNA polegająca na łańcuchowej reakcji polimerazy DNA w wyniku wielokrotnego podgrzewania i oziębiania próbki elektroforeza Możliwe odpowiedzi: 1. materiał genetyczny kodujący większość informacji genetycznej organizmu, 2. metoda rozdziału mieszaniny związków chemicznych w polu elektrycznym, 3. materiał genetyczny zawarty w podstawowym (haploidalnym) zespole chromosomów, 4. metoda powielania łańcuchów DNA polegająca na łańcuchowej reakcji polimerazy DNA w wyniku wielokrotnego podgrzewania i oziębiania próbki

Ćwiczenie 7

Pterois (skrzydlice, ognice) to jadowite ryby z rodziny skorpenowatych (Scorpaenidae). Są one rodzime dla Oceanu Indyjskiego oraz Pacyfiku, jednakże w 1986 r. dwa gatunki (Pterois volitans i Pterois miles) zostały rozprzestrzenione również na obszary Atlantyku, w efekcie wpuszczenia do jego wód ryb akwariowych. W 2009 r. gatunki te niebezpiecznie rozprzestrzeniły się w całym zachodnim Atlantyku: od Nowego Jorku aż po wybrzeża Wenezueli. Od tego czasu liczba tych ryb gwałtownie rośnie.

RLEJiARMsljXD

Ilustracja przedstawia rybę w wodzie. Jej ciało jest dość silnie bocznie spłaszczone, ma paski. Promienie płetw piersiowych i pierwszej płetwy grzbietowej są połączone ze sobą tylko u nasady, przez co rozkładają się szeroko. Ciało ubarwione jaskrawo, z poprzecznymi pręgami występującymi również na promieniach płetw. Ubarwienie jest biało‑czerwone‑czarne. — Ognica pstra (*Pterois volitans*).
Źródło: Alexander Vasenin, Wikimedia Commons, licencja: CC BY-SA 3.0.

R1LKBfEkK6AdY

Wyjaśnij, jak zastosowanie barkodingu DNA pomoże naukowcom poznać wpływ inwazji ryb z rodzaju Pterois na rodzime gatunki, społeczności i ekosystemy. (Uzupełnij).

Ryby z rodzaju Pterois zjadają ponad 100 różnych gatunków. Jak można je zidentyfikować?

Przeprowadzenie sekcji zwłok ryb z rodzaju Pterois umożliwi wyodrębnienie ofiar pożeranych przez te ryby. Wówczas można zidentyfikować je za pomocą barkodingu DNA, a następnie wprowadzić strategie ochrony wrażliwych gatunków.

Ćwiczenie 8

Barkoding DNA to technika molekularna, która umożliwia identyfikację poszczególnych gatunków poprzez porównanie krótkich sekwencji DNA próbki z sekwencjami referencyjnymi. Sukces tego przedsięwzięcia zależy od: zmienności genetycznej między gatunkami oraz dostępności wysokiej jakości sekwencji DNA.

Barkoding DNA jest komercyjnie wykorzystywany do identyfikacji żywności oraz oceny jej jakości.

RAilU22ACqlmI

Wymień ograniczenia stosowania barkodingu DNA w identyfikacji żywności. (Uzupełnij).

Zastanów się, czy możliwe jest rozróżnienie wszystkich gatunków. Jaki wpływ na tę metodę ma uszkodzenie DNA?

Barkoding DNA nie zawsze pozwala prawidłowo zidentyfikować organizm. Jest to trudne zwłaszcza w przypadku zwierząt gospodarskich, ponieważ wiele ich gatunków, m.in. bydła, powstało na skutek hybrydyzacji. Problemy sprawia również identyfikacja żywności przetworzonej – podczas przetwarzania struktura DNA wielu składników (np. nasion, owoców, zwierząt) może zostać przekształcona w wyniku zabiegów fizycznych (ogrzewanie, gotowanie, promieniowanie UV itd.) lub chemicznych (dodanie środków konserwujących, sztucznych substancji słodzących itd.). Z tego powodu stosowanie kodów kreskowych DNA na towarach pochodzących z organizmów transformowanych genetycznie może być nieskuteczne.

Grafika interaktywna

Dla nauczyciela

Sprawdź się