Najważniejszym czynnikiem umożliwiającym nasionom kiełkowanie jest woda. Stanowi ona zaledwie 5–15% masy większości nasion, które podlane lub zmoczone deszczem łatwo pęcznieją. Ilość wody potrzebnej do kiełkowania różni się w zależności od gatunku rośliny. Na przykład nasiona wielu roślin pustynnych zaczynają kiełkować tylko po obfitych opadach, co jest konsekwencją ich przystosowania do życia w suchym klimacie. Mają one wysoką zawartość kwasu abscysynowego (ABA), który odpowiada m.in. za stan spoczynku. Pod wpływem dużej ilości wody stężenie ABA spada, co jest sygnałem do rozpoczęcia kiełkowania. Dlatego nawet tak sucha pustynia jak Atakama po jednym ulewnym deszczu, który występuje zwykle co kilka lat, zamienia się w łąkę zachwycającą różnorodnością roślin.