W Systemie idealizmu transcendentalnego Schelling starał się stworzyć całkowity system filozoficzny. Rozwinął go zgodnie z zasadami transcendentalnego idealizmu. Na filozofię Schellinga składają się m.in. rozważania nad rolą, jaką w rozwoju człowieka odgrywa samookreślanie się woli, którą filozof postrzegał  jako inteligencję. Snuł również rozważania na temat różnicy między popędami a wolą działającą zgodnie z jakimś ideałem, co pozwoliło mu stworzyć podstawy systemu moralnego i prawnego.