Korzeń to organ roślinny, który dostarcza roślinie wodę i sole mineralne oraz przytwierdza ją do podłoża. Może również mieć formę organu spichrzowego u roślin wieloletnich.

Cechami odróżniającymi korzeń od łodygi są bezlistność (z korzenia mogą wyrastać tylko pędy przybyszowe), odmienny niż w łodydze układ waskularny, sposób powstawania i charakter skórki oraz zazwyczaj brak chloroplastów. W odróżnieniu od pędu merystem wierzchołkowy korzenia jest pokryty przyrośniętą do niego czapeczką korzeniową.

Prawidłowe przygotowanie preparatu z korzenia wraz z odpowiednio dobraną metodą barwienia pozwala na uwidocznienie pod mikroskopem świetlnym wszystkich tkanek tego organu. Na podstawie takiej obserwacji można określić, czy roślina, z której pochodzi dany fragment korzenia, jest rośliną jedno- czy dwuliścienną, a także jaką budowę (pierwotną czy wtórną) prezentuje korzeń.