Na schemacie przedstawiono fragment cząsteczki białka o strukturze trzeciorzędowej oraz warunkujące tę strukturę różne oddziaływania występujące pomiędzy łańcuchami bocznymi aminokwasów: wiązania chemiczne oparte na przyciąganiu elektrostatycznym - na ilustracji to wiązanie pomiędzy grupą OH a atomem tlenu, wiązania kowalencyjne - to wiązanie pomiędzy dwoma atomami siarki, interakcje hydrofobowe - na ilustracji są dwa niepolarne łańcuchy boczne aminokwasów, to dwie cząsteczki o budowie: grupa metylowa łączy się w dół z grupa CH a ta w dół z kolejna grupą metylową. Dwie cząsteczki są naprzeciwko siebie w łańcuchu polipeptydowym. Znajdują się w niebieskim kwadracie. Kolejno zaznaczono oddziaływanie jonowe - Występuje ono w środkowej części wzoru cząsteczki i jest to NH indeks dolny 3 indeks górny plus O indeks górny minus. Łańcuch polipeptydowy ma pofałdowany, nieregularny kształt. Jest koloru niebieskiego.