Ilustracja przedstawia drzewo obrazujące stosunki filogenetyczne u naczelnych 1. Liść (węzeł zewnętrzny) Końcowy (terminalny) węzeł, odpowiadający badanej sekwencji/jednostce taksonomicznej (np. gatunek), 2. Węzeł wewnętrzny Miejsce łączenia się gałęzi - reprezentuje hipotetycznego wspólnego przodka, 3. Gałąź Reprezentuje związki ewolucyjne między porównywanymi jednostkami taksonomicznymi; ich długość może odpowiadać zmianom w sekwencjach nagromadzonych podczas ewolucji, 4. Korzeń Wspólny przodek dla wszystkich taksonów, 5. Grupa zewnętrzna (outgrupa) Takson, który jest najdalej spokrewniony z pozostałymi badanymi sekwencjami; uległ on specjacji najwcześniej; służy m.in. do celów porównawczych i prawidłowego ulokowania korzenia, 6. Gałąź Reprezentuje związki ewolucyjne między porównywanymi jednostkami taksonomicznymi; ich długość może odpowiadać zmianom w sekwencjach nagromadzonych podczas ewolucji, pozwala na prawidłowe ukorzenienie drzewa, 7. Grupa wewnętrzna Takson, który jest spokrewniony z pozostałymi badanymi sekwencjami, 8. Węzeł wewnętrzny Miejsce łączenia się gałęzi - reprezentuje hipotetycznego wspólnego przodka