bg‑yellow

Czym jest proces denaturacji?

W trakcie smażenia jajka na patelni łatwo zaobserwować zmianę jego zabarwienia i struktury. Pod wpływem wysokiej temperatury pojawia się nowy twór, który właściwościami fizycznymi nie przypomina materii sprzed kilku minut. Sprawcą całego zdarzenia jest denaturacja.

Proces ten polega na utracie aktywności biologicznej oraz zniszczeniu struktur białek: drugo-, trzecio- i czwartorzędowych. Nie zostaje zmieniona jedynie struktura pierwszorzędowa, ponieważ wiązania peptydowe są wystarczająco silne, żeby pozostać nierozerwane. Podczas denaturacji zostają jednak zerwane wiązania stabilizujące pozostałe struktury białka, przez co dochodzi do zmian we właściwościach fizycznych i chemicznych protein. Ogólny schemat denaturacji przedstawiono poniżej.

RGquSDuMxUfcj
Ogólny schemat dentauracji
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
bg‑yellow

Czynniki wpływające na denaturację białek

Białka mogą ulegać denaturacji pod wpływem wielu różnych czynników, które ogólnie podzielono na dwie grupy – czynniki fizyczne i chemiczne – co zostało przedstawione na poniższej mapie myśli.

RjtJTrce0KPLR1
Mapa myśli. Lista elementów:
  • Nazwa kategorii: Czynniki denaturujące
    • Elementy należące do kategorii Czynniki denaturujące
    • Nazwa kategorii: Fizyczne
      • Elementy należące do kategorii Fizyczne
      • Nazwa kategorii: Temperatura
      • Nazwa kategorii: Ciśnienie
      • Nazwa kategorii: Wytrząsanie
      • Nazwa kategorii: Promieniowanie UV i RTG
      • Nazwa kategorii: Promieniowanie jonizujące
      • Nazwa kategorii: Ultradźwięki
      • Koniec elementów należących do kategorii Fizyczne
    • Nazwa kategorii: Chemiczne
      • Elementy należące do kategorii Chemiczne
      • Nazwa kategorii: Sole metali ciężkich
      • Nazwa kategorii: Mocne kwasy i zasady
      • Nazwa kategorii: Etanol
      • Nazwa kategorii: Detergenty
      • Nazwa kategorii: Niektóre kwasy organiczne
      • Nazwa kategorii: Sole amonowe
      • Koniec elementów należących do kategorii Chemiczne
      Koniec elementów należących do kategorii Czynniki denaturujące
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.

Temperatura

Wysoka temperatura (dla niektórych białek wystarczy 40°C) powoduje rozerwanie wiązań wodorowych i oddziaływań hydrofobowych. Dzieje się tak, ponieważ podwyższając temperaturę, dostarczamy do układu dodatkową energię, która zwiększa energię kinetycznąenergia kinetycznaenergię kinetyczną układu. Powoduje to zwiększony ruch cząsteczek. W ten sposób dochodzi do zerwania wiązań. W życiu codziennym takie zjawisko zachodzi podczas gotowania produktów żywnościowych. Zdenaturowane białka są bardziej podatne na działanie licznych enzymów, co ułatwia nam trawienie pożywienia i wchłanianie potrzebnych substancji odżywczych. Również podczas sterylizacjisterylizacjasterylizacji narzędzi czy opatrunków medycznych zwiększa się temperaturę. Tak niszczone są białka, które występują w patogenach, a tym samym zostają unieszkodliwione potencjalne mikroorganizmy, wywołujące choroby.

Może także dojść do tzw. zimnej denaturacji, z którą mamy do czynienia przy niskiej temperaturze i wysokim ciśnieniu (powyżej 0,2 GPa). Takie warunki sprzyjają zmniejszeniu oddziaływań hydrofobowych, wówczas struktura białka ulega rozwinięciu. Na poniższym wykresie zaprezentowano rodzaje denaturacji i jej zależność od temperatury i ciśnienia.

R1dhQUmyL1AKz1
Wykres przedstawiający wpływ temperatury i ciśnienia na strukturę białek
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.

Promieniowanie UV

Promieniowanie UV, nazywane również promieniowaniem nadfioletowym, to promieniowanie elektromagnetyczne o długości około 300400 nm. W zależności od długości fali, wyróżnia się promieniowanie UVA, UVB i UVC. Słońce emituje fale we wszystkich trzech zakresach, natomiast na Ziemię dociera tylko część promieniowania UVB i całe UVA, które jest mniej szkodliwe dla człowieka niż pozostałe rodzaje. Promieniowanie UV w dużych dawkach powoduje rozerwanie wiązań wodorowych w białkach, co prowadzi do zniszczenia struktur drugo-, trzecio-, i czwartorzędowych. Dlatego długotrwałe narażanie się na promienie słoneczne nie jest wskazane ze względu na zwiększenie ryzyka zachorowań na nowotwory skóry. Jednak minimalna dawka promieniowania jest potrzebna dla organizmu do produkcji witaminy D3.

Wytrząsanie

Gwałtowne mieszanie czy ubijanie białka powoduje zerwanie wiązań wodorowych. To właśnie dzieje się w momencie ubijania piany z białek. Dochodzi wtedy do zerwania wiązań i wprowadzenia pęcherzyków gazów do układu. Następnie cząsteczki białek tworzą nowe wiązania, które oplatają cząsteczki gazów, tworząc tym samym strukturę piany. Schemat reakcji zamieszczono poniżej. Proces tworzenia nowych wiązań w białku nosi nazwę koagulacjikoagulacjakoagulacji.

  • niebieskie tło to cząsteczki wody;

  • zwinięte kłębki to białko;

  • fale to zdenaturowane białka;

  • białe okręgi w środku to pęcherzyki powietrza.

Etanol

Ten związek chemiczny zrywa wiązania wodorowe w białkach i wiążę się z grupami chemicznymi białek. Dla przykładu: etanol 70% ma zdolność do przenikania przez ściany komórkowe bakterii i denaturacji obecnych w mikroorganizmach białek i enzymów, co prowadzi do śmierci komórki. Taka właściwość alkoholu, nazywana bakteriobójczą, jest wykorzystywana do dezynfekcji. Spożywanie etanolu sprawia, że białka, które budują nasz organizm, ulegają denaturacji i przez to nie mogą pełnić swoich funkcji. Etanol znajduje się w piwie, winie czy innych wyrobach alkoholowych.

RE0LhNMYvSBEc1
Wpływ etanolu na strukturę czwartorzędową białek
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.

Sole metali ciężkich

Sole metali ciężkich to związki chemiczne zawierające jony: Hg2+, Pb2+, Ag+, Tl+, Cd2+ i jony innych metali o gęstości większej niż 4,5 gcm3. Niszczą one wiązania jonowewiązania jonowewiązania jonowe w białku i prowadzą do zniszczenia mostków solnychmostki solnemostków solnychmostków disiarczkowychmostki disiarczkowemostków disiarczkowych. Produktem takiej reakcji jest sól białka i metalu ciężkiego. Taką właściwość wykorzystuje się w przypadku zatrucia organizmu związkami metali ciężkich. Pacjentowi podaje się białko, które wytrąca sól, a następnie wywołuje się wymioty, usuwające z organizmu toksyny. Na przykład osobie zatrutej solami rtęci należy podać do wypicia mleko z białkiem kurzym, by doprowadzić do mdłości. W tym przypadku białka, zawarte w mleku i białku kurzym, wychwytują jony rtęci i są usuwane z organizmu.

Mocne kwasy i zasady

Mocne kwasy i zasady ulegają dysocjacji elektrolitycznejdysocjacja elektrolitycznadysocjacji elektrolitycznej w roztworze rozpuszczalnika. Zaburzają one wiązania jonowe w mostkach solnychmostki solnemostkach solnych w białku, niszcząc jego strukturę natywnąstruktura natywnastrukturę natywną.

R981ajvAngw0C1
Wpływ kwasów i zasad na mostki solne białek
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.

Zaprezentowane powyżej przykłady denaturacji nie są wszystkimi możliwymi reakcjami. Wśród związków chemicznych, które powodują zniszczenie struktury natywnej białka, znajdują się m.in.: mocznik, guanidyna, SDS (sól sodowa siarczanu(VI) dodecylu).

RuXAAhvj1lJgj1
Mocznik Ilustracja przedstawiająca wzór cząsteczki mocznika, który zbudowany jest z atomu węgla połączonego za pomocą wiązania podwójnego z atomem tlenu oraz za pomocą wiązań pojedynczych z dwiema grupami NH2., Guanidyna Ilustracja przedstawiająca wzór cząsteczki guanidyny, który zbudowany jest z atomu węgla połączonego za pomocą wiązania podwójnego z atomem azotu grupy NH oraz za pomocą wiązań pojedynczych z dwiema grupami NH2., SDS (sól sodowa siarczanu(VI) dodecylu) Ilustracja przedstawiająca wzór cząsteczki soli sodowej siarczanu(VI) dodecylu, która to zbudowana jest z atomu siarki połączonego z czterema atomami tlenu, w tym z dwoma za pomocą wiązań podwójnych, a z pozostałym za pomocą wiązań pojedynczych. Jeden z atomów tlenu związany za pomocą wiązania pojedynczego z siarką obdarzony jest ładunkiem ujemnym kompensowanym przez kation sodu Na+. Drugi atom tlenu związany za pomocą wiązania podjedynczego z siarką podstawiony jest z jedenastoma kolejno połączonymi ze sobą grupami CH2, z których ostatnia podstawiona jest grupą metylową CH3.
Źródło: GroMar sp.z.o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
bg‑yellow

Czy denaturacja białka jest procesem nieodwaracalnym?

Denaturacja nie jest procesem nieodwracalnym. W początkowym jego etapie, po usunięciu czynnika denaturującego, może dojść do odtworzenia struktury natywnej białka. Takie zjawisko nazywa się renaturacją. Schemat został przedstawiony poniżej. Przykładem denaturacji odwracalnej jest zastosowanie soli amonowych, których użycie prowadzi do usunięcia płaszcza wodnego białka i zmiany jego struktury przestrzennej. Po dodaniu wody, białko wraca do struktury wyjściowej. Do czynników fizycznych, przyczyniających się do denaturacji nieodwracalnej, zaliczamy: ogrzewanie, silnie mieszanie, wytrząsanie, naświetlanie promieniowaniem nadfioletowym, rentgenowskimi i jonizującym lub działanie ultradźwiękami. Natomiast denaturacja chemiczna zachodzi w obecności mocznika, chlorku guanidyny, na skutek działania kwasów i zasad, soli metali ciężkich, alkoholi. Wszystkie te czynniki powodują rozerwanie wiązań wodorowych, jonowych, mostków disiarczkowych, czyli niszczą wiązania, które stabilizują strukturę łańcuchów polipeptydowych.

RWT5hu6QpWRSH1
Na schemacie struktura białka w postaci helisy, która pod wpływem denaturacji ulega rozpadowi i przyjmuje nieuporządkowaną nić. W wyniku renaturacji ponownie ulega skręceniu.
Ogólny schemat denaturacji i renaturacji
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.

Właściwości zdenaturowanego białka

Białko zdenaturowane posiada inne właściwości fizyczne i chemiczne, ze względu na zmiany w swojej strukturze.

Zdenaturowane białka, oprócz utraty swojej aktywności biologicznej, wykazują również większą podatność na działanie enzymów proteolitycznychenzymy proteolityczneenzymów proteolitycznych oraz zmiany w rozpuszczalności i lepkości. Podczas denaturacji dochodzi także do odsłonięcia grup chemicznych, które były dotychczas schowane we wnętrzu białka, co może prowadzić do zwiększenia ich aktywności.

Denaturacja w życiu codziennym

Denaturacja jest sposobem człowieka na walkę z patogenami. Wykorzystywana jest przez nas w codziennym życiu, w kuchni lub łazience. Warto więc wiedzieć, że jajecznica to tak naprawdę zniszczone białko, z którego nie da się już zrobić kogla‑mogla.

Słownik

promieniowanie jonizujące
promieniowanie jonizujące

każdy rodzaj promieniowania, który wywołuje powstanie jonu z danego atomu lub cząsteczki; do takiego promieniowania zalicza się promieniowanie alfa, beta i gamma

energia kinetyczna
energia kinetyczna

energia związana z ruchem danego układu

sterylizacja
sterylizacja

zniszczenie wszystkich form mikroorganizmów w danym otoczeniu; stosowana m.in.: w medycynie i produkcji żywności

promieniowanie UV
promieniowanie UV

promieniowanie elektromagnetyczne o długości fali około 100 nm400 nm, niewidzialne dla człowieka

promieniowanie RTG
promieniowanie RTG

promieniowanie elektromagnetyczne o długości fali około 0,1 nm10 nm

ultradźwięki
ultradźwięki

zbyt wysokie fale dźwiękowe, aby usłyszał je człowiek; znalazły zastosowanie m. in.: w medycynie – dzięki nim można uzyskać obraz narządów wewnętrznych

dysocjacja elektrolityczna
dysocjacja elektrolityczna

proces rozpadu cząsteczek związków chemicznych na jony pod wpływem rozpuszczalnika

mostki solne
mostki solne

połączenia powstające pomiędzy resztami aminokwasowymi naładowanymi dodatnio (np. lizyną) a resztami aminokwasowymi naładowanymi ujemnie (np. asparaginą)

struktura natywna
struktura natywna

w przypadku białek, to struktura, która umożliwia prawidłowe funkcjonowanie białek

wiązania jonowe
wiązania jonowe

wiązanie chemiczne pomiędzy dwoma różnoimiennymi ładunkami

mostki disiarczkowe
mostki disiarczkowe

połączenia utworzone przez dwa atomy siarki, które są częścią tego samego związku chemicznego

koagulacja
koagulacja

proces łączenia się pojedynczych cząstek substancji rozproszonej w większe skupiska (agregaty) oraz wytrącaniu ich z układu w postaci osadu

enzymy proteolityczne
enzymy proteolityczne

enzymy, które hydrolizują wiązania peptydowe

Bibliografia

Ban‑Oganowska H. i in. Ćwiczenia laboratoryjne z biochemii i chemii żywności, Wrocław 2006.

Doonan S., Zawadzki Z., Białka i peptydy, tłum. Z. Zawadzki, Warszawa 2008.

Kłyszejko‑Stefanowicz L., Ćwiczenia z biochemii, Warszawa 2003.

Stryer L., Berg J. M., Tymoczko J. L., Biochemia. Część 1. Molekularny wzór życia, Warszawa 2009, wyd. 4.